More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1756 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 310 aa  601  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0061  threonine dehydratase  47.37 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.983835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2783  threonine dehydratase  48.34 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3496  threonine dehydratase  45.36 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3420  threonine dehydratase  49.5 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3768  threonine dehydratase  46.45 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2589  threonine dehydratase  44.19 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4798  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  47.59 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1622  Threonine ammonia-lyase  45.33 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00676892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1610  threonine dehydratase  45.07 
 
 		 318 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.346941 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.89 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1852  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.53 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  35.14 
 
 		 511 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.26 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4030  threonine dehydratase  40.47 
 
 		 320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3011  threonine dehydratase  37 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  33.99 
 
 		 501 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0952  threonine dehydratase  39.86 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  37.79 
 
 		 520 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  34.58 
 
 		 507 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2922  threonine dehydratase  38.41 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2234  threonine dehydratase  35.41 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  36.43 
 
 		 501 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  37.85 
 
 		 514 aa  146  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  36.79 
 
 		 504 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  36.2 
 
 		 504 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  40.79 
 
 		 414 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  34.51 
 
 		 418 aa  145  8.000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  34.74 
 
 		 509 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3336  threonine dehydratase  39.19 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  29.3 
 
 		 511 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1741  threonine dehydratase  41.58 
 
 		 310 aa  142  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0307895  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  35.71 
 
 		 403 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  31.15 
 
 		 514 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.87 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  34.19 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  29.3 
 
 		 511 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  35.57 
 
 		 506 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  35.57 
 
 		 506 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 507 aa  139  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0087  threonine dehydratase  36.33 
 
 		 504 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  34.23 
 
 		 503 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  35.29 
 
 		 506 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  34.92 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3492  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.7 
 
 		 338 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.948459  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  35.4 
 
 		 526 aa  136  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  36.75 
 
 		 515 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  34.29 
 
 		 515 aa  136  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  35.83 
 
 		 403 aa  136  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  35.13 
 
 		 502 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  34.85 
 
 		 515 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  35.21 
 
 		 504 aa  135  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  29.67 
 
 		 513 aa  135  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  33.93 
 
 		 405 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  30.03 
 
 		 402 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  30.72 
 
 		 403 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  31.56 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  33.57 
 
 		 527 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  35.34 
 
 		 511 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2738  threonine dehydratase  34.08 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 503 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  33.88 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  35.34 
 
 		 504 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  34.84 
 
 		 505 aa  133  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  32.58 
 
 		 509 aa  133  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1820  threonine dehydratase, biosynthetic  31.67 
 
 		 505 aa  133  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  31.35 
 
 		 517 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  31.35 
 
 		 517 aa  132  6e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3386  L-threonine ammonia-lyase  31.39 
 
 		 503 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.08 
 
 		 321 aa  132  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  32.14 
 
 		 504 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  36.19 
 
 		 402 aa  131  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  31.7 
 
 		 403 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  33.77 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3806  threonine dehydratase, biosynthetic  34.63 
 
 		 507 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.276753  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  34.63 
 
 		 514 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  36.51 
 
 		 402 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  32.24 
 
 		 402 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  32.04 
 
 		 402 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  33 
 
 		 503 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  35.92 
 
 		 519 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  27.06 
 
 		 403 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0056  threonine dehydratase  34.7 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595  hitchhiker  0.00751641 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0303  threonine dehydratase  35.86 
 
 		 565 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0613066  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  33.23 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  28.38 
 
 		 403 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  40.47 
 
 		 412 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  34.85 
 
 		 519 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  27.6 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  32.99 
 
 		 549 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  35.56 
 
 		 530 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1311  threonine dehydratase, biosynthetic  34.11 
 
 		 503 aa  129  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.484078  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  37.72 
 
 		 403 aa  129  6e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  34.29 
 
 		 403 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  31.27 
 
 		 401 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  34.94 
 
 		 411 aa  129  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  33.57 
 
 		 504 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  33.8 
 
 		 504 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  33.57 
 
 		 504 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  33.45 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>