More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1686 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1686  ribosomal protein S9  100 
 
 		 161 aa  320  5e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4949  30S ribosomal protein S9  77.5 
 
 		 171 aa  240  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143487  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  76.92 
 
 		 167 aa  238  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1158  30S ribosomal protein S9  77.85 
 
 		 158 aa  234  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.356107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1131  30S ribosomal protein S9  77.85 
 
 		 158 aa  234  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1148  30S ribosomal protein S9  77.85 
 
 		 158 aa  234  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.542588  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1470  30S ribosomal protein S9  87.41 
 
 		 171 aa  234  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  81.6 
 
 		 162 aa  208  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  78.46 
 
 		 174 aa  206  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13479  30S ribosomal protein S9  87.79 
 
 		 151 aa  204  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0104915  hitchhiker  0.000207065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4467  ribosomal protein S9  79.69 
 
 		 139 aa  204  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  70.54 
 
 		 154 aa  185  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  75.2 
 
 		 135 aa  184  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16860  30S ribosomal protein S9  60.13 
 
 		 162 aa  179  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3863  30S ribosomal protein S9  77.52 
 
 		 154 aa  176  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6564  ribosomal protein S9  76.8 
 
 		 216 aa  176  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0743813  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  69.92 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4253  30S ribosomal protein S9  77.52 
 
 		 154 aa  176  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3105  ribosomal protein S9  61.94 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  69.53 
 
 		 162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29350  SSU ribosomal protein S9P  68.7 
 
 		 162 aa  171  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  66.41 
 
 		 171 aa  166  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0618  ribosomal protein S9  66.41 
 
 		 163 aa  165  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  56.05 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  67.19 
 
 		 169 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0615  SSU ribosomal protein S9P  73.98 
 
 		 135 aa  160  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  0.442005 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  62.5 
 
 		 166 aa  158  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  64.06 
 
 		 169 aa  157  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  54.14 
 
 		 172 aa  157  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0972  ribosomal protein S9  58.11 
 
 		 173 aa  156  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0537605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2630  30S ribosomal protein S9  54.22 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0662  ribosomal protein S9  68.57 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178699  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2917  30S ribosomal protein S9  62.9 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954546  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  61.79 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  57.72 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  60.16 
 
 		 130 aa  141  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0721  30S ribosomal protein S9  57.89 
 
 		 167 aa  140  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  58.54 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4283  ribosomal protein S9  62.6 
 
 		 171 aa  137  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23240  SSU ribosomal protein S9P  55.21 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  53.97 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  54.76 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  56.91 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  57.72 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 128 aa  133  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  53.97 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0719  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000482758  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  56.1 
 
 		 131 aa  132  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  56.1 
 
 		 131 aa  132  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  60.32 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  59.35 
 
 		 130 aa  131  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3731  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  57.72 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  55.28 
 
 		 131 aa  130  6.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 131 aa  130  9e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  54.92 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1624  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.567552  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1320  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540344  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2587  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 138 aa  127  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  48.72 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0905  ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.122737  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0224  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 135 aa  127  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  57.72 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17131  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 136 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0453537  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2993  ribosomal protein S9  53.49 
 
 		 132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.113743  hitchhiker  0.00813341 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2984  30S ribosomal protein S9  54.4 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0221  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.010853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  48.99 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>