More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1685 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  100 
 
 		 147 aa  303  7e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  72.11 
 
 		 147 aa  229  9e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1157  50S ribosomal protein L13  72.11 
 
 		 147 aa  227  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.341835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1130  50S ribosomal protein L13  72.11 
 
 		 147 aa  227  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1147  50S ribosomal protein L13  72.11 
 
 		 147 aa  227  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0869  ribosomal protein L13  73.65 
 
 		 148 aa  227  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13480  50S ribosomal protein L13  70.07 
 
 		 147 aa  226  7e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00156161  hitchhiker  0.000481946 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  70.75 
 
 		 150 aa  224  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  70.07 
 
 		 147 aa  224  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  68.71 
 
 		 147 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  68.71 
 
 		 147 aa  218  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  69.39 
 
 		 147 aa  214  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  69.39 
 
 		 147 aa  214  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 147 aa  213  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  68.71 
 
 		 147 aa  212  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  67.35 
 
 		 147 aa  211  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  68.71 
 
 		 147 aa  212  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  68.71 
 
 		 147 aa  211  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  68.03 
 
 		 147 aa  210  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  68.03 
 
 		 147 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  68.03 
 
 		 147 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 147 aa  210  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  65.31 
 
 		 149 aa  209  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 147 aa  209  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0889  50S ribosomal protein L13  65.99 
 
 		 147 aa  209  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  65.99 
 
 		 147 aa  208  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  67.35 
 
 		 149 aa  208  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2918  50S ribosomal protein L13  71.43 
 
 		 147 aa  208  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  68.03 
 
 		 147 aa  207  5e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  64.63 
 
 		 147 aa  206  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  67.35 
 
 		 147 aa  206  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2631  50S ribosomal protein L13  70.75 
 
 		 147 aa  205  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  65.31 
 
 		 147 aa  204  4e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  63.27 
 
 		 149 aa  202  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20530  LSU ribosomal protein L13P  66.44 
 
 		 149 aa  200  5e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.780175  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  63.95 
 
 		 147 aa  198  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  60.42 
 
 		 154 aa  190  5e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1693  50S ribosomal protein L13  59.18 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0818735  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  58.62 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0252  ribosomal protein L13  58.5 
 
 		 149 aa  184  4e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 146 aa  180  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  58.39 
 
 		 148 aa  178  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 144 aa  177  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 151 aa  176  7e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  55.15 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  55.15 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 143 aa  169  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  54.86 
 
 		 149 aa  167  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 144 aa  167  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 151 aa  167  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 150 aa  167  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  56.12 
 
 		 143 aa  167  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 151 aa  167  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 147 aa  166  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  57.78 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  57.78 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2969  50S ribosomal protein L13  56.16 
 
 		 154 aa  164  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0186742  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0801  50S ribosomal protein L13  48.61 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  52.08 
 
 		 150 aa  164  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0022  50S ribosomal protein L13  54.79 
 
 		 154 aa  164  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550014  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1651  50S ribosomal protein L13  54.79 
 
 		 154 aa  164  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2176  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 154 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25669  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>