57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1628 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  47.89 
 
 		 1166 aa  1023    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  45.27 
 
 		 1144 aa  934    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  46.98 
 
 		 1133 aa  909    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  45.28 
 
 		 1143 aa  930    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  47.4 
 
 		 1124 aa  931    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  45.76 
 
 		 1121 aa  926    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  45.67 
 
 		 1122 aa  959    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  46.26 
 
 		 1121 aa  950    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  45.41 
 
 		 1123 aa  866    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  48.54 
 
 		 1140 aa  956    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  46.43 
 
 		 1121 aa  937    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  46.92 
 
 		 1125 aa  943    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  100 
 
 		 1130 aa  2298    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  45.49 
 
 		 1125 aa  936    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  45.95 
 
 		 1121 aa  942    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  46.48 
 
 		 1121 aa  929    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1126 aa  419  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1137 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  30.67 
 
 		 1124 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  29.69 
 
 		 1143 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  28 
 
 		 1133 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1128 aa  332  3e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  27.15 
 
 		 1118 aa  295  2e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  26.5 
 
 		 1136 aa  272  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1120 aa  262  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1118 aa  230  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1120 aa  229  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1120 aa  229  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  24.84 
 
 		 1154 aa  228  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1120 aa  227  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1126 aa  220  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  24.91 
 
 		 1153 aa  216  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  46.93 
 
 		 352 aa  197  9e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1146 aa  184  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1151 aa  183  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1045 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  24.23 
 
 		 979 aa  171  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1120 aa  155  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1125 aa  151  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1114 aa  139  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  24.4 
 
 		 694 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1181 aa  128  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1121 aa  92  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  27.21 
 
 		 406 aa  86.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  24.85 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  25.99 
 
 		 1159 aa  62.4  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  25.15 
 
 		 1093 aa  62  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  24.45 
 
 		 1207 aa  59.3  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  22.24 
 
 		 1109 aa  58.2  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  26.87 
 
 		 1113 aa  57.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0895  hypothetical protein  64.71 
 
 		 54 aa  57  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  19.76 
 
 		 1107 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3062  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1140 aa  52  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1141 aa  47.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0098  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1214 aa  46.6  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  24.25 
 
 		 1159 aa  45.1  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1374  hypothetical protein  32.52 
 
 		 406 aa  44.7  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.643705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>