31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1627 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1627  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  784    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1134  hypothetical protein  39.69 
 
 		 384 aa  247  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0734  hypothetical protein  35.64 
 
 		 404 aa  245  9e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00069101 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0844  hypothetical protein  34.47 
 
 		 397 aa  237  3e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0891  hypothetical protein  35.88 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0225  hypothetical protein  36.22 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010208 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0740  hypothetical protein  36.27 
 
 		 395 aa  232  7.000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0783  hypothetical protein  34.21 
 
 		 391 aa  229  8e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0014  conserved hypothetical cytosolic protein  35.04 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1443  hypothetical protein  34.56 
 
 		 391 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0515  hypothetical protein  34.87 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2293  hypothetical protein  36.67 
 
 		 395 aa  223  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893787  normal  0.236124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1808  hypothetical protein  34.46 
 
 		 391 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2281  hypothetical protein  33.94 
 
 		 405 aa  215  8e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2188  hypothetical protein  33.16 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0052  conserved hypothetical cytosolic protein  32.03 
 
 		 441 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03540  hypothetical protein  33.15 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3161  hypothetical protein  30.89 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22920  hypothetical protein  39.66 
 
 		 426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0062  hypothetical protein  29.78 
 
 		 413 aa  126  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0867  hypothetical protein  27.29 
 
 		 429 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1439  hypothetical protein  41.27 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03285  hypothetical protein  31.62 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157228  unclonable  1.30992e-21 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0874  hypothetical protein  26.07 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3324  hypothetical protein  54.79 
 
 		 101 aa  73.9  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0425  hypothetical protein  28.06 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3695  hypothetical protein  27.39 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000243995 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0776  hypothetical protein  22.02 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0148333 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17250  hypothetical protein  36.49 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0584  hypothetical protein  26.76 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0788  hypothetical protein  46.43 
 
 		 92 aa  50.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>