29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1610 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1610  sodium/glutamate symporter  100 
 
 		 443 aa  867    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02230  Na+/glutamate symporter  64.11 
 
 		 459 aa  518  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2908  sodium/glutamate symporter  37.75 
 
 		 470 aa  290  5.0000000000000004e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1785  sodium/glutamate symporter  37.1 
 
 		 471 aa  286  4e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2269  sodium/glutamate symporter  40.41 
 
 		 479 aa  281  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1560  sodium/glutamate symporter  35.62 
 
 		 472 aa  281  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000409416 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0776  sodium/glutamate symporter  37.91 
 
 		 462 aa  272  7e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1728  sodium/glutamate symporter  36.88 
 
 		 471 aa  266  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2615  sodium/glutamate symporter  35.73 
 
 		 494 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00493587  normal  0.013038 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0232  sodium/glutamate symporter  37.85 
 
 		 489 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.413045 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06891  sodium/solute symporter family protein  30.96 
 
 		 461 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0067  putative sodium:solute symporter, ESS family  31.62 
 
 		 461 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03801  putative sodium:solute symporter, ESS family  31.87 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2370  sodium/glutamate symporter  34.28 
 
 		 458 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07361  sodium/solute symporter family protein  29.82 
 
 		 456 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06841  sodium/solute symporter family protein  28.95 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.195837  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06551  sodium/solute symporter family protein  26.89 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.40603  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06941  sodium/solute symporter family protein  27.21 
 
 		 459 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0628  sodium/solute symporter family protein  28.19 
 
 		 461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003562  sodium/glutamate symporter  24.5 
 
 		 456 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0701  sodium/glutamate symporter  26.62 
 
 		 448 aa  113  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2214  sodium/glutamate symporter  26.28 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14970  Na+/glutamate symporter  26.7 
 
 		 466 aa  99  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0610514  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1935  sodium:glutamate symporter  24.78 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1375  sodium/glutamate symporter  24.6 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4718  sodium/glutamate symporter  23.57 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.193762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4181  sodium/glutamate symporter  23.18 
 
 		 404 aa  43.9  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0036  sodium/glutamate symporter  22.73 
 
 		 404 aa  43.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0040  sodium/glutamate symport carrier protein  22.73 
 
 		 404 aa  43.1  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>