More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1581 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1581  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  100 
 
 
413 aa  811    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  63.86 
 
 
395 aa  471  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  52.08 
 
 
413 aa  368  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.56 
 
 
399 aa  345  8e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  45.21 
 
 
405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  43.24 
 
 
401 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  43.87 
 
 
401 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1495  hypothetical protein  50.12 
 
 
403 aa  317  3e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0879599  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.19 
 
 
403 aa  315  6e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.64 
 
 
412 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.06 
 
 
393 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  45.81 
 
 
433 aa  315  9e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  43.64 
 
 
412 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.64 
 
 
412 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.39 
 
 
412 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  44.88 
 
 
405 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.08 
 
 
393 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  45.12 
 
 
405 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  46.93 
 
 
405 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  45.55 
 
 
420 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0889  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  50.61 
 
 
398 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0906  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.61 
 
 
398 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.03 
 
 
412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.03 
 
 
451 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.03 
 
 
412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.03 
 
 
412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.03 
 
 
412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0895  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.12 
 
 
398 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0424541 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.03 
 
 
412 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  42.86 
 
 
420 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  41.83 
 
 
406 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.83 
 
 
393 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  41.6 
 
 
413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  43.14 
 
 
425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.7 
 
 
407 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.11 
 
 
413 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  43.12 
 
 
440 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2549  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.63 
 
 
434 aa  299  7e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  44.5 
 
 
424 aa  299  7e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.48 
 
 
400 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  44.61 
 
 
413 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.48 
 
 
404 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.86 
 
 
413 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.11 
 
 
413 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.08 
 
 
416 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  42.42 
 
 
415 aa  294  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.21 
 
 
404 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2054  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.18 
 
 
415 aa  291  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.876427  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  43.04 
 
 
440 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1147  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.95 
 
 
400 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.95 
 
 
404 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  39.71 
 
 
397 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  43.46 
 
 
414 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0092  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.95 
 
 
404 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362932  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  43.23 
 
 
412 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2934  hypothetical protein  43.77 
 
 
411 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34550  hypothetical protein  43.77 
 
 
411 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  44.36 
 
 
402 aa  287  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  40.44 
 
 
414 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5155  acyl-CoA dehydrogenase  38.89 
 
 
422 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1903  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  43.53 
 
 
417 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.71 
 
 
410 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  38.85 
 
 
392 aa  277  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2985  acyl-CoA dehydrogenase family protein  39.65 
 
 
426 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2572  putative acyl-CoA dehydrogenase  41.98 
 
 
393 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2550  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.14 
 
 
413 aa  269  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405659  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0554  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.8 
 
 
417 aa  268  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1545  hypothetical protein  41.73 
 
 
416 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828601  normal  0.5845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2361  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.52 
 
 
412 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00969514  hitchhiker  0.0011963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1778  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.67 
 
 
425 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251662  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0024  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.16 
 
 
418 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.641341 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6061  acyl-CoA dehydrogenase  42.77 
 
 
326 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0877  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.16 
 
 
429 aa  259  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485998  normal  0.261313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34320  DszC family monooxygenase  39.6 
 
 
411 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.404084  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2916  hypothetical protein  39.6 
 
 
411 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3957  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  43.43 
 
 
419 aa  256  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0790683  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3664  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.68 
 
 
419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3501  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.33 
 
 
411 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102842  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3488  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  40.33 
 
 
411 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3551  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.33 
 
 
411 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058709  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2008  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.16 
 
 
425 aa  254  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200025  hitchhiker  0.00322208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3951  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  42.93 
 
 
419 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.865313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1779  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.34 
 
 
430 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392008  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4228  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.58 
 
 
412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2571  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.42 
 
 
420 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.28 
 
 
410 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2009  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.73 
 
 
411 aa  239  9e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0963467  hitchhiker  0.00351271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3173  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.34 
 
 
415 aa  236  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203103  normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2440  acyl-CoA dehydrogenase family protein  37.21 
 
 
395 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0806323  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4516  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.93 
 
 
395 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.130533 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2439  acyl-CoA dehydrogenase family protein  38.13 
 
 
403 aa  226  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4227  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.88 
 
 
418 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0340079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1377  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.31 
 
 
409 aa  202  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0469267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.84 
 
 
409 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3296  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.28 
 
 
409 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.187192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2116  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.58 
 
 
403 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708611  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0695  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  36.14 
 
 
390 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.801723  normal  0.240956 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3947  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.32 
 
 
403 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0180672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3463  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  34.58 
 
 
400 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.32 
 
 
400 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>