More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1524 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1524  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
407 aa  813    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1805  acetyl-CoA acetyltransferase  71.67 
 
 
404 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1758  acetyl-CoA acetyltransferase  71.67 
 
 
404 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1739  acetyl-CoA acetyltransferase  71.18 
 
 
404 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126801  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1976  acetyl-CoA acetyltransferase  68.97 
 
 
405 aa  567  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4368  acetyl-CoA acetyltransferase  68.47 
 
 
405 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3827  acetyl-CoA acetyltransferase  66.83 
 
 
403 aa  524  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241233  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1802  acetyl-CoA acetyltransferase  65.35 
 
 
407 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1860  acetyl-CoA acetyltransferase  64.53 
 
 
402 aa  501  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00028581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2726  acetyl-CoA acetyltransferase  61.67 
 
 
404 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7151  acetyl-CoA acetyltransferase  61.52 
 
 
405 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3929  acetyl-CoA acetyltransferase  64.53 
 
 
403 aa  481  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.041846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1347  acetyl-CoA acetyltransferase  60 
 
 
403 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.901733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4166  acetyl-CoA acetyltransferase  58.91 
 
 
407 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0142  acetyl-CoA acetyltransferase  51.94 
 
 
402 aa  391  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.771451  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0124  acetyl-CoA acetyltransferase  51.7 
 
 
402 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0192  acetyl-CoA acetyltransferase  50.97 
 
 
402 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7332  acetyl-CoA acetyltransferase  50.24 
 
 
401 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213335  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1222  acetyl-CoA acetyltransferase  50.49 
 
 
404 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0492457  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6898  acetyl-CoA acetyltransferase  49.51 
 
 
398 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2896  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 
404 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1491  acetyl-CoA acetyltransferase  42.79 
 
 
393 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  43.46 
 
 
391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  45.48 
 
 
394 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  45.34 
 
 
402 aa  319  3.9999999999999996e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  44.63 
 
 
401 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  45.83 
 
 
392 aa  315  8e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2284  acetyl-CoA acetyltransferase  42.57 
 
 
392 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  44.23 
 
 
394 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  44.23 
 
 
394 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2722  acetyl-CoA acetyltransferase  40.59 
 
 
391 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  41.09 
 
 
391 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  41.09 
 
 
391 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  40.84 
 
 
391 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  40.84 
 
 
391 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  40.84 
 
 
391 aa  311  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  40.84 
 
 
391 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  41.09 
 
 
391 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  40.84 
 
 
391 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  44.36 
 
 
394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  40.84 
 
 
391 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  44 
 
 
392 aa  310  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  44.23 
 
 
394 aa  308  9e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  43.5 
 
 
392 aa  308  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  44.25 
 
 
403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3780  acetyl-CoA acetyltransferase  40.59 
 
 
391 aa  306  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514238  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  42.75 
 
 
392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  43.25 
 
 
392 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  42.51 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  42.51 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.52 
 
 
424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  43.52 
 
 
398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  43.77 
 
 
398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0314  acetyl-CoA acetyltransferase  42.51 
 
 
400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0364767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  44.63 
 
 
392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  43.07 
 
 
392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  42.5 
 
 
392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  44.23 
 
 
394 aa  302  7.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2256  acetyl-CoA acetyltransferase  44.33 
 
 
390 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.672895  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  42.72 
 
 
394 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  42.5 
 
 
392 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.87 
 
 
404 aa  301  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  42.75 
 
 
394 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  44.69 
 
 
394 aa  301  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  42.44 
 
 
398 aa  300  3e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3041  acetyl-CoA acetyltransferase  40.25 
 
 
392 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  43.73 
 
 
395 aa  300  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  42.96 
 
 
394 aa  299  5e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  43.73 
 
 
394 aa  300  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4150  acetyl-CoA acetyltransferase  42.43 
 
 
393 aa  299  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  41.52 
 
 
394 aa  298  8e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  44.88 
 
 
402 aa  299  8e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  41.09 
 
 
393 aa  298  1e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  43.42 
 
 
408 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  43.24 
 
 
394 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  42.72 
 
 
394 aa  298  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3374  acetyl-CoA acetyltransferase  44.53 
 
 
393 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  41.58 
 
 
390 aa  297  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3117  acetyl-CoA acetyltransferase  42.93 
 
 
393 aa  297  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  42.51 
 
 
394 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  44.07 
 
 
402 aa  296  4e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  41.79 
 
 
394 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2026  acetyl-CoA acetyltransferase  43.56 
 
 
391 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1441  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  43.89 
 
 
393 aa  296  5e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0922147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.9 
 
 
401 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  44.94 
 
 
393 aa  295  8e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  42.68 
 
 
393 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.6 
 
 
400 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  41.65 
 
 
391 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  43.7 
 
 
397 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.17 
 
 
401 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  43.46 
 
 
397 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  41.95 
 
 
399 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.63 
 
 
399 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1134  acetyl-CoA acetyltransferase  41.46 
 
 
398 aa  293  3e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0917  acetyl-CoA acetyltransferase  46.96 
 
 
412 aa  293  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  43.7 
 
 
394 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  41.87 
 
 
390 aa  293  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  43.98 
 
 
394 aa  293  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  42.96 
 
 
394 aa  293  5e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>