More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1513 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
305 aa  592  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  68.48 
 
 
298 aa  361  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11029  dimethyladenosine transferase  61.89 
 
 
317 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4642  dimethyladenosine transferase  62.01 
 
 
294 aa  335  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0320106  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4349  dimethyladenosine transferase  62.01 
 
 
294 aa  335  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4263  dimethyladenosine transferase  61.65 
 
 
294 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4800  dimethyladenosine transferase  61.29 
 
 
311 aa  333  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  67.03 
 
 
316 aa  333  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1933  dimethyladenosine transferase  61.65 
 
 
314 aa  333  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164143  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  64.16 
 
 
281 aa  318  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3232  dimethyladenosine transferase  65.49 
 
 
310 aa  314  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1213  dimethyladenosine transferase  61.75 
 
 
295 aa  312  4.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.284392  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4556  dimethyladenosine transferase  62.11 
 
 
302 aa  312  5.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1283  dimethyladenosine transferase  65.22 
 
 
290 aa  311  5.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000558155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  65.36 
 
 
288 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0975  dimethyladenosine transferase  66.31 
 
 
324 aa  301  7.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139064  hitchhiker  0.00622345 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3856  dimethyladenosine transferase  64.71 
 
 
297 aa  301  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  60.65 
 
 
302 aa  296  4e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32460  dimethyladenosine transferase  62.72 
 
 
284 aa  291  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.956525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0589  dimethyladenosine transferase  66.9 
 
 
306 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  60.5 
 
 
293 aa  285  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30300  dimethyladenosine transferase  61.84 
 
 
320 aa  285  7e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.222246 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  64.34 
 
 
289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1045  dimethyladenosine transferase  64.49 
 
 
300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46051  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0405  dimethyladenosine transferase  61.72 
 
 
287 aa  275  7e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05390  dimethyladenosine transferase  59.15 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0963646  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  52.33 
 
 
302 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0906  dimethyladenosine transferase  66.19 
 
 
288 aa  270  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00888376  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1008  dimethyladenosine transferase  57.61 
 
 
281 aa  269  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0782  dimethyladenosine transferase  64.34 
 
 
289 aa  268  8.999999999999999e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13736  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1452  dimethyladenosine transferase  52.04 
 
 
307 aa  262  4e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0767  dimethyladenosine transferase  61.79 
 
 
291 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1952  dimethyladenosine transferase  56.74 
 
 
600 aa  257  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0178  dimethyladenosine transferase  53.02 
 
 
290 aa  256  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.279271 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13300  dimethyladenosine transferase  55.9 
 
 
295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0481014  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2725  dimethyladenosine transferase  59.93 
 
 
303 aa  251  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0854  dimethyladenosine transferase  57.53 
 
 
319 aa  232  7.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3964  dimethyladenosine transferase  58.65 
 
 
251 aa  206  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  39.31 
 
 
293 aa  185  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  44.6 
 
 
284 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  39.64 
 
 
293 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04920  dimethyladenosine transferase  42.11 
 
 
296 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.775461  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  34.27 
 
 
305 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  36 
 
 
284 aa  172  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  42.24 
 
 
279 aa  172  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  36.94 
 
 
285 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  36.94 
 
 
285 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  39.79 
 
 
288 aa  169  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  35.81 
 
 
297 aa  168  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  37.05 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  36.69 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  31.65 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  36.69 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  36.69 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1084  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  36.69 
 
 
292 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  36.69 
 
 
292 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  36.69 
 
 
292 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  36.69 
 
 
292 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  36.69 
 
 
292 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  36.69 
 
 
292 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  36.69 
 
 
292 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  35.97 
 
 
290 aa  161  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  40.77 
 
 
297 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  42.11 
 
 
276 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  38.7 
 
 
266 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  33.92 
 
 
292 aa  160  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 
267 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 
267 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  35 
 
 
296 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  40 
 
 
267 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  33.21 
 
 
295 aa  157  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  35.42 
 
 
301 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  32.27 
 
 
280 aa  156  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  35.97 
 
 
292 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07480  dimethyladenosine transferase  35.99 
 
 
296 aa  155  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.962879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  38.93 
 
 
272 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 
287 aa  155  9e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 
256 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  38.4 
 
 
266 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 
287 aa  152  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 
268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  36.73 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  40.67 
 
 
274 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  32.17 
 
 
291 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  36.07 
 
 
297 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  36.07 
 
 
297 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  40.5 
 
 
281 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  36.19 
 
 
285 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 
256 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  40.77 
 
 
265 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 
278 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 
296 aa  149  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  43.8 
 
 
262 aa  149  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2658  ribosomal RNA adenine methylase transferase  34.06 
 
 
347 aa  149  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 
272 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 
266 aa  149  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  35.64 
 
 
276 aa  149  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>