127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1493 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  60.46 
 
 		 784 aa  930    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  55.68 
 
 		 804 aa  873    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1171  glycoside hydrolase family protein  52.56 
 
 		 787 aa  801    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  58.51 
 
 		 810 aa  893    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2887  family 65 glycoside hydrolase  56.41 
 
 		 824 aa  825    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1188  Kojibiose phosphorylase  52.56 
 
 		 787 aa  801    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  54.37 
 
 		 794 aa  825    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  57.35 
 
 		 784 aa  845    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1198  Kojibiose phosphorylase  52.56 
 
 		 787 aa  801    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51521  normal  0.0335974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1073  Kojibiose phosphorylase  53.55 
 
 		 789 aa  804    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  100 
 
 		 786 aa  1627    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0438  Kojibiose phosphorylase  54.33 
 
 		 791 aa  841    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  62.93 
 
 		 807 aa  1006    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  56.43 
 
 		 787 aa  840    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13436  hypothetical protein  53.81 
 
 		 786 aa  793    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0422368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1472  Kojibiose phosphorylase  54.62 
 
 		 790 aa  830    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  46.77 
 
 		 780 aa  662    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  55.43 
 
 		 800 aa  869    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0525  Kojibiose phosphorylase  55.13 
 
 		 791 aa  819    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.659551  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2513  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  55.58 
 
 		 786 aa  820    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  43.12 
 
 		 795 aa  598  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  42.08 
 
 		 795 aa  591  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  41.67 
 
 		 790 aa  588  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  41.15 
 
 		 790 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0089  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  41.94 
 
 		 777 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472584  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  41.7 
 
 		 795 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  42.26 
 
 		 858 aa  566  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  41.59 
 
 		 848 aa  568  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  42.25 
 
 		 825 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0258  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  41.67 
 
 		 782 aa  548  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  40.33 
 
 		 843 aa  541  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  40.83 
 
 		 834 aa  532  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  37.3 
 
 		 780 aa  532  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  38.02 
 
 		 781 aa  528  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  35 
 
 		 780 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  34.73 
 
 		 778 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  36.41 
 
 		 767 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0531  Kojibiose phosphorylase  36.21 
 
 		 781 aa  449  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0308  Kojibiose phosphorylase  36.82 
 
 		 786 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  32.72 
 
 		 788 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  34.69 
 
 		 778 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  32.28 
 
 		 789 aa  411  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 		 986 aa  364  4e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  26.84 
 
 		 805 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  30.07 
 
 		 750 aa  300  9e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000286879  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  28.91 
 
 		 775 aa  294  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  28.67 
 
 		 780 aa  293  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  28.92 
 
 		 774 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  29.82 
 
 		 710 aa  286  9e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  29 
 
 		 755 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  29.41 
 
 		 757 aa  285  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  28.16 
 
 		 763 aa  285  3.0000000000000004e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  29.11 
 
 		 771 aa  281  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  30.46 
 
 		 720 aa  280  9e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.46 
 
 		 778 aa  277  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  28.74 
 
 		 755 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  28.4 
 
 		 787 aa  274  4.0000000000000004e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  28.48 
 
 		 755 aa  274  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  28.48 
 
 		 755 aa  274  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1847  maltose phosphorylase  26.46 
 
 		 751 aa  273  7e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.24 
 
 		 762 aa  273  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  28.06 
 
 		 755 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  29.36 
 
 		 759 aa  271  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.7939 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  28.34 
 
 		 755 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  28.34 
 
 		 755 aa  270  7e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  28.34 
 
 		 755 aa  270  7e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  26.2 
 
 		 768 aa  269  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  26.46 
 
 		 765 aa  268  2e-70  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0216  maltose phosphorylase  28.65 
 
 		 758 aa  269  2e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000286832  hitchhiker  0.00000374663 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  27.93 
 
 		 755 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  26.76 
 
 		 767 aa  266  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  29.96 
 
 		 748 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  28.01 
 
 		 965 aa  266  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  24.9 
 
 		 759 aa  265  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  29.39 
 
 		 761 aa  263  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  29.53 
 
 		 761 aa  261  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  30.76 
 
 		 760 aa  259  9e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  28.34 
 
 		 978 aa  259  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.95 
 
 		 749 aa  259  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  27.26 
 
 		 781 aa  258  4e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  26.78 
 
 		 789 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  27 
 
 		 752 aa  243  1e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  26.88 
 
 		 807 aa  243  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  35.11 
 
 		 777 aa  243  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  27.51 
 
 		 752 aa  242  2.9999999999999997e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  27.2 
 
 		 787 aa  240  6.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  26.83 
 
 		 794 aa  239  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  27.19 
 
 		 748 aa  233  8.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  26.21 
 
 		 769 aa  232  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  27.78 
 
 		 807 aa  230  9e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  27.94 
 
 		 776 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  27.32 
 
 		 753 aa  226  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1155  Kojibiose phosphorylase  26.81 
 
 		 704 aa  206  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.162173  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  25.75 
 
 		 1314 aa  198  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3531  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.48 
 
 		 794 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.607347  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2162  trehalose 6-phosphate phosphorylase  26.9 
 
 		 807 aa  197  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.40305 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.22 
 
 		 1052 aa  196  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  25.93 
 
 		 1053 aa  196  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.06 
 
 		 1051 aa  193  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  25.89 
 
 		 1088 aa  192  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>