75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1454 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  100 
 
 		 597 aa  1233    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0843  ATPase  33.02 
 
 		 602 aa  264  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000396112  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  31.96 
 
 		 586 aa  243  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  37.24 
 
 		 486 aa  78.6  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2294  hypothetical protein  26.22 
 
 		 549 aa  67.8  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  27.31 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2778  hypothetical protein  26.67 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000124034  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2370  AAA ATPase  22.98 
 
 		 454 aa  54.7  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  31.43 
 
 		 595 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3178  putative ATP binding protein  28.32 
 
 		 496 aa  53.9  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.033124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00360  ABC transporter, ATP-binding protein-related protein  30.15 
 
 		 636 aa  53.5  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  28.42 
 
 		 708 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  32.05 
 
 		 409 aa  52  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5059  AAA ATPase  25.85 
 
 		 518 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.32918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  33.66 
 
 		 450 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  31.25 
 
 		 567 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  25.93 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  42.31 
 
 		 464 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1888  hypothetical protein  28.57 
 
 		 437 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0155  AAA ATPase  23.33 
 
 		 544 aa  49.7  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.754147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  31.51 
 
 		 441 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  34.91 
 
 		 532 aa  48.9  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4235  ATPase-like protein  30.12 
 
 		 187 aa  48.9  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  45.83 
 
 		 642 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  34.21 
 
 		 465 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  36.46 
 
 		 676 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  27.01 
 
 		 591 aa  47.8  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  26.02 
 
 		 429 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  28.28 
 
 		 346 aa  48.1  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  49.09 
 
 		 427 aa  47.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  30.36 
 
 		 567 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  40.74 
 
 		 428 aa  47.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  43.4 
 
 		 496 aa  47.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  29.7 
 
 		 457 aa  47.4  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  27.52 
 
 		 408 aa  47.4  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  44.9 
 
 		 681 aa  47  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  31.52 
 
 		 654 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  38.81 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  21.58 
 
 		 367 aa  47  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  40.3 
 
 		 448 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  31.4 
 
 		 224 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.99 
 
 		 616 aa  47  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.19 
 
 		 652 aa  46.2  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  35 
 
 		 228 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  27.01 
 
 		 580 aa  46.2  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  47.62 
 
 		 1177 aa  45.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1481  hypothetical protein  27.96 
 
 		 140 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  52.94 
 
 		 1190 aa  45.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  34.57 
 
 		 377 aa  45.8  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  27.5 
 
 		 623 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  26.76 
 
 		 497 aa  45.4  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0049  prophage Lp2 protein 4  27.07 
 
 		 558 aa  45.4  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.19169  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  47.83 
 
 		 680 aa  45.8  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  30.19 
 
 		 382 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  33.33 
 
 		 452 aa  45.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  31.43 
 
 		 416 aa  45.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  29.89 
 
 		 369 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  30.19 
 
 		 382 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2274  AAA ATPase  25.98 
 
 		 602 aa  44.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.363979 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  27.47 
 
 		 349 aa  44.7  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  51.43 
 
 		 1177 aa  44.3  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  30.95 
 
 		 368 aa  44.3  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  32.84 
 
 		 423 aa  44.3  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  38.67 
 
 		 459 aa  44.3  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  44.19 
 
 		 1181 aa  44.3  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  40.48 
 
 		 1139 aa  44.3  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  31.78 
 
 		 410 aa  44.3  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  36.36 
 
 		 336 aa  44.3  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  32.65 
 
 		 367 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  51.43 
 
 		 1178 aa  43.9  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  30.61 
 
 		 378 aa  43.9  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  32.65 
 
 		 367 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  26.87 
 
 		 583 aa  43.9  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  41.03 
 
 		 1141 aa  43.9  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  22.22 
 
 		 628 aa  43.9  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>