More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1453 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
342 aa  694    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  46.02 
 
 
375 aa  315  8e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  45.82 
 
 
371 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  40.58 
 
 
373 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  41.71 
 
 
352 aa  263  3e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  41.72 
 
 
354 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  41.04 
 
 
344 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  40.35 
 
 
349 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  40.06 
 
 
366 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  39.42 
 
 
358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.75 
 
 
359 aa  242  7e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  41.76 
 
 
355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  40.35 
 
 
371 aa  232  9e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  34.01 
 
 
345 aa  229  7e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  37.86 
 
 
350 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  37.67 
 
 
373 aa  216  5.9999999999999996e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  37.2 
 
 
340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  36.87 
 
 
362 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  37.65 
 
 
365 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  35.31 
 
 
374 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  33.94 
 
 
395 aa  186  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  33.25 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  35.41 
 
 
361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.82 
 
 
387 aa  169  8e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  32.49 
 
 
381 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  31.82 
 
 
415 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.6 
 
 
404 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  29.79 
 
 
385 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.53 
 
 
415 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  32.54 
 
 
424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  31.81 
 
 
355 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  33.92 
 
 
398 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.14 
 
 
357 aa  152  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  30.34 
 
 
468 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  32.35 
 
 
319 aa  150  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  31.4 
 
 
440 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  31.4 
 
 
440 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  27.52 
 
 
360 aa  143  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  28.03 
 
 
421 aa  142  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  27.79 
 
 
423 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  27.51 
 
 
423 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  31.77 
 
 
434 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  32.11 
 
 
438 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 
361 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  31.45 
 
 
359 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.17 
 
 
431 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  30.88 
 
 
488 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  30.92 
 
 
310 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  29.44 
 
 
431 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  27.45 
 
 
438 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  30.83 
 
 
671 aa  136  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  27.99 
 
 
652 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  29.67 
 
 
418 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  31.49 
 
 
365 aa  135  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  29.67 
 
 
418 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  34.71 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  29.53 
 
 
446 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.28 
 
 
397 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  31.39 
 
 
399 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  32.84 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  28.38 
 
 
370 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  29.28 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  28.32 
 
 
443 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  26.32 
 
 
689 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  29.7 
 
 
657 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  26.63 
 
 
362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  26.82 
 
 
686 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  29.36 
 
 
313 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  29.74 
 
 
334 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  29.81 
 
 
400 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  26.32 
 
 
698 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 
434 aa  122  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  25.96 
 
 
388 aa  122  9e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06638  C5 cytosine methyltransferase DmtAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q876R1]  30.41 
 
 
615 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0121285  normal  0.227283 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  32.07 
 
 
313 aa  120  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.29 
 
 
312 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  29.8 
 
 
345 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  29.25 
 
 
337 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  30.45 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  29.62 
 
 
358 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  31.67 
 
 
662 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  26.53 
 
 
489 aa  116  6e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  29.08 
 
 
361 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  31.27 
 
 
386 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  25.61 
 
 
465 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  29.14 
 
 
358 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  30.5 
 
 
317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 
323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  29.71 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  28.99 
 
 
308 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  27.17 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.56 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  30.11 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  27.07 
 
 
414 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  26.11 
 
 
364 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  33.15 
 
 
406 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  27.83 
 
 
313 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  29.89 
 
 
429 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>