More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1419 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  100 
 
 		 390 aa  790    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  54.4 
 
 		 433 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  47.67 
 
 		 365 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  45.81 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  40.11 
 
 		 370 aa  222  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  36.32 
 
 		 407 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  41.38 
 
 		 367 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  38.19 
 
 		 424 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  38.38 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  36.22 
 
 		 402 aa  170  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  32.63 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  32.55 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  32.41 
 
 		 378 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  29.86 
 
 		 394 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  33.15 
 
 		 370 aa  123  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  28.17 
 
 		 404 aa  117  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  26.91 
 
 		 422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  33.22 
 
 		 451 aa  113  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  28.85 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  25.56 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  28.54 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  27.83 
 
 		 395 aa  106  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  32.78 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  27.45 
 
 		 395 aa  103  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.91 
 
 		 392 aa  102  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  29.18 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.58 
 
 		 443 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25.42 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  28.81 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  33.61 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  27.86 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  27.93 
 
 		 451 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.3 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.3 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  32.75 
 
 		 416 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  27.57 
 
 		 435 aa  93.6  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  29.36 
 
 		 373 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25.91 
 
 		 369 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12333  integrase  46.15 
 
 		 151 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  30.23 
 
 		 402 aa  90.5  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3333  hypothetical protein  53.12 
 
 		 182 aa  90.5  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  25.37 
 
 		 369 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.4 
 
 		 414 aa  89.4  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  22.18 
 
 		 293 aa  89  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  27.61 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  23.12 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.4 
 
 		 369 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  27.18 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.87 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  24.71 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0915  Tn916, transposase  25.99 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  22.84 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  28.16 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.28 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  22.84 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  27.48 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13783  integrase  71.43 
 
 		 71 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.763684 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  23.06 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.87 
 
 		 376 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.87 
 
 		 376 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2767  integrase family protein  28.83 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000543052  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  23.22 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  27.6 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  24.49 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  27.87 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  23.44 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  32.28 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  28.48 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  27.1 
 
 		 454 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  26.76 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  26.76 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.56 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  23.73 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  24.22 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.56 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  28.63 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  27.12 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  27.98 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  23.81 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25.6 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.91 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  33.33 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  24.07 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.91 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.56 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.56 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.56 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.56 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  24.31 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.56 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4219  phage integrase family protein  29.22 
 
 		 463 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.56 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.56 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  29.32 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  28.23 
 
 		 309 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1590  phage integrase family protein  36.2 
 
 		 198 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  24.71 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  27.19 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.14 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>