258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1408 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1408  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 274 aa  528  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4672  large-conductance mechanosensitive channel  50.39 
 
 		 151 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419542  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4294  large-conductance mechanosensitive channel  50.39 
 
 		 151 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4380  large-conductance mechanosensitive channel  50.39 
 
 		 151 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.443969  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0624  large conductance mechanosensitive channel protein  43.18 
 
 		 176 aa  118  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4049  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 152 aa  118  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11003  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 151 aa  112  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.00405e-34  normal  0.629119 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4648  large conductance mechanosensitive channel protein  45.99 
 
 		 146 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4838  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 		 144 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3277  large conductance mechanosensitive channel protein  58.06 
 
 		 148 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1892  large-conductance mechanosensitive channel  47.37 
 
 		 147 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.211789 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13070  large conductance mechanosensitive channel protein  40 
 
 		 151 aa  96.3  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00812185  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0090  large conductance mechanosensitive channel protein  39.42 
 
 		 151 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.343086  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16810  mscL large conductance mechanosensitive channel protein  44.7 
 
 		 140 aa  92.4  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230846  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30610  large conductance mechanosensitive channel protein  40.16 
 
 		 164 aa  92  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0156749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0900  large conductance mechanosensitive channel protein  38.06 
 
 		 166 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1428  large conductance mechanosensitive channel protein  44.09 
 
 		 126 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  42.19 
 
 		 129 aa  89  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2624  large conductance mechanosensitive channel protein  40.71 
 
 		 129 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.462758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  39.13 
 
 		 131 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6488  large conductance mechanosensitive channel protein  42.52 
 
 		 169 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23920  large conductance mechanosensitive channel protein  44.72 
 
 		 125 aa  87.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.814868 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0070  large conductance mechanosensitive channel protein  41.41 
 
 		 131 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2817  large conductance mechanosensitive channel protein  39.37 
 
 		 130 aa  85.5  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234312  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2197  large conductance mechanosensitive channel protein  41.98 
 
 		 132 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.270032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0305  large conductance mechanosensitive channel protein  46.46 
 
 		 131 aa  84  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2915  large conductance mechanosensitive channel protein  38.85 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  40.18 
 
 		 134 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2342  large conductance mechanosensitive channel protein  38.17 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0832  large conductance mechanosensitive channel protein  35.34 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  39.64 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  40.6 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  41.35 
 
 		 127 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  36.76 
 
 		 126 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1924  Large-conductance mechanosensitive channel  34.78 
 
 		 168 aa  78.2  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.79206  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3137  large conductance mechanosensitive channel protein  41.22 
 
 		 127 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  43.88 
 
 		 145 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1165  large conductance mechanosensitive channel protein  38.76 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.423534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  40.85 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  42.42 
 
 		 127 aa  75.1  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0038  large conductance mechanosensitive channel protein  41.75 
 
 		 136 aa  73.9  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  39.53 
 
 		 131 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  43.4 
 
 		 132 aa  74.3  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  38.41 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4091  large conductance mechanosensitive channel protein  38.05 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  39 
 
 		 138 aa  72  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  36.88 
 
 		 145 aa  72  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  38.57 
 
 		 138 aa  72  0.000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  38.13 
 
 		 139 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  39.69 
 
 		 121 aa  70.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  44.55 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  37.31 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  37.4 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1972  large conductance mechanosensitive channel protein  34.92 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  36.55 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  35.46 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  37.32 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  37.06 
 
 		 138 aa  68.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  37.06 
 
 		 138 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  36.88 
 
 		 138 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5645  large conductance mechanosensitive channel protein  39 
 
 		 174 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0366128  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  37.78 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  40.22 
 
 		 146 aa  67  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  36.62 
 
 		 146 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  34.97 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  33.79 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  34.27 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  36.96 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  34.93 
 
 		 163 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  34.51 
 
 		 140 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  36.64 
 
 		 126 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  40 
 
 		 140 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0871  large conductance mechanosensitive channel protein  36.88 
 
 		 137 aa  64.3  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  37.31 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  35.29 
 
 		 132 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1409  large-conductance mechanosensitive channel  37.4 
 
 		 120 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000924927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1436  large-conductance mechanosensitive channel  37.4 
 
 		 120 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000693237  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  37.36 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  36.5 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  36.5 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1319  large conductance mechanosensitive channel protein  37.69 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1343  large conductance mechanosensitive channel protein  30.71 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.954232  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  34.88 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  35.29 
 
 		 132 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  35.09 
 
 		 157 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0850  large-conductance mechanosensitive channel  38.35 
 
 		 129 aa  61.2  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  32.89 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  35.97 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  34.51 
 
 		 134 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  37.78 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  36.69 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1425  large conductance mechanosensitive channel protein  38.06 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  36.17 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  32.85 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  32.85 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  31.51 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1428  large conductance mechanosensitive channel protein  35.61 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000461871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  34.96 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  30 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>