More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1398 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 349 aa  667    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  54.03 
 
 		 420 aa  311  9e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11001  serine protease pepD  59.62 
 
 		 464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000053367  normal  0.424973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.22 
 
 		 440 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.22 
 
 		 440 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.22 
 
 		 440 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1889  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.37 
 
 		 515 aa  295  8e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4842  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  55.59 
 
 		 456 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.26 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  51.67 
 
 		 485 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  50.96 
 
 		 674 aa  265  8.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  50.79 
 
 		 423 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  48.16 
 
 		 583 aa  261  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.19 
 
 		 512 aa  259  6e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  47.52 
 
 		 443 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  50.32 
 
 		 569 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.35 
 
 		 558 aa  246  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  50.32 
 
 		 640 aa  245  9e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0813  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  50.16 
 
 		 485 aa  240  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  44.25 
 
 		 527 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2158  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  53.14 
 
 		 507 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0489221  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50 
 
 		 579 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.54 
 
 		 487 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.57 
 
 		 439 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.08 
 
 		 523 aa  229  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06450  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  49.17 
 
 		 517 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.75 
 
 		 524 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.77 
 
 		 471 aa  225  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1153  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.25 
 
 		 436 aa  223  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  49.04 
 
 		 597 aa  223  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3830  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.54 
 
 		 515 aa  222  7e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778945  normal  0.0341938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.43 
 
 		 518 aa  219  6e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.35 
 
 		 506 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0886  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.74 
 
 		 916 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0797  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.2 
 
 		 512 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  45.74 
 
 		 489 aa  216  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  47 
 
 		 537 aa  215  8e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0658  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.15 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  45.63 
 
 		 614 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  45.18 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0659  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.82 
 
 		 428 aa  212  7.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397901  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.16 
 
 		 544 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  46.08 
 
 		 584 aa  210  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  43.36 
 
 		 539 aa  211  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.36 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.482576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  45.95 
 
 		 575 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7403  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.59 
 
 		 618 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0667  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.12 
 
 		 376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.99 
 
 		 497 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  44.44 
 
 		 515 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.55 
 
 		 497 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  42.9 
 
 		 528 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  42.76 
 
 		 508 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.92 
 
 		 501 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.92 
 
 		 501 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  42.31 
 
 		 491 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  41.03 
 
 		 496 aa  196  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  43.2 
 
 		 385 aa  196  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  41.44 
 
 		 514 aa  196  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  42.56 
 
 		 503 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.52 
 
 		 475 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.52 
 
 		 475 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.96 
 
 		 486 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.52 
 
 		 475 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  41.18 
 
 		 520 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  44.92 
 
 		 552 aa  194  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.34 
 
 		 496 aa  193  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1069  PDZ/DHR/GLGF domain protein  41.42 
 
 		 497 aa  193  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.905759  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  42.91 
 
 		 504 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0535  2-alkenal reductase  44.26 
 
 		 469 aa  192  6e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.227386 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  40.91 
 
 		 502 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  40.91 
 
 		 461 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.81 
 
 		 545 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  40.91 
 
 		 502 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  40.91 
 
 		 502 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  40.91 
 
 		 485 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  40.91 
 
 		 502 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  40.91 
 
 		 502 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  41.4 
 
 		 490 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  41.1 
 
 		 491 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  40.77 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0225  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  42.31 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  40.07 
 
 		 507 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  41.4 
 
 		 500 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  40.48 
 
 		 501 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  40.28 
 
 		 502 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  41.4 
 
 		 499 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  41.4 
 
 		 499 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  40.28 
 
 		 505 aa  188  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  41.4 
 
 		 498 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  42.91 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  38.63 
 
 		 511 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  40.56 
 
 		 485 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  41.4 
 
 		 498 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  39.38 
 
 		 493 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  41.4 
 
 		 498 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  39.38 
 
 		 498 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  40.49 
 
 		 474 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  45.21 
 
 		 506 aa  187  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  40.74 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>