More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1371 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 287 aa  554  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.22 
 
 		 286 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.062918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.22 
 
 		 286 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.22 
 
 		 286 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0961261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75 
 
 		 292 aa  354  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.57 
 
 		 273 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.54 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1323  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  50.57 
 
 		 260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0560082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.58 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.453695  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1503  taurine ABC transporter, permease protein  42.91 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.36 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.73 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  37.13 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  36.84 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  36.84 
 
 		 275 aa  149  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  36.84 
 
 		 275 aa  148  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  36.84 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  36.84 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  40.98 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  40.98 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  36.84 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  40.98 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 		 275 aa  146  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 		 279 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  38.54 
 
 		 285 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6225  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  38.15 
 
 		 320 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  36.47 
 
 		 275 aa  145  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  36.84 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 		 412 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  36.84 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2477  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.93 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.97 
 
 		 269 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.97 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 		 280 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 		 284 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  34.66 
 
 		 330 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.53 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4207  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  40.35 
 
 		 289 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.53 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  37.44 
 
 		 253 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  37.07 
 
 		 283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  37.07 
 
 		 253 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  37.07 
 
 		 283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  37.44 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  37.44 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0085  taurine ABC transporter inner membrane protein  40.97 
 
 		 283 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.135193 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 		 275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197989  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0692  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  34.88 
 
 		 306 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000618741  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 		 275 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 		 272 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0949532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7166  taurine uptake ABC transporter permease protein  36.47 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.1 
 
 		 282 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 		 283 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  33.2 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  33.19 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  33.19 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.12 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.81 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.14 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00472137  normal  0.430362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  39.11 
 
 		 272 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.201741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.86 
 
 		 256 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  30.56 
 
 		 272 aa  125  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  33.22 
 
 		 272 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 		 256 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16627  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 		 272 aa  125  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 		 281 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2719  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.13 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 		 291 aa  122  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2640  alkanesulfonates transport system permease; sulfonate ABC transporter, permease  33.61 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.4 
 
 		 275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1796  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  36.27 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2663  alkanesulfonates transport system permease; sulfonate ABC transporter, permease  33.61 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21990  ABC transporter, inner membrane permease component  33.33 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2959  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 		 284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.132224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.51 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0102858  normal  0.0961586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>