More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1362 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  62.36 
 
 
540 aa  679  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  59.55 
 
 
546 aa  635  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  62.36 
 
 
540 aa  679  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  61.99 
 
 
540 aa  675  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  59.78 
 
 
1043 aa  667  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  69.29 
 
 
552 aa  753  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  62.8 
 
 
550 aa  698  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  60.59 
 
 
546 aa  659  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  59.07 
 
 
546 aa  648  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  60.22 
 
 
546 aa  658  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  66.17 
 
 
549 aa  723  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  67.65 
 
 
547 aa  735  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1362  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
542 aa  1117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00632075  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  64.67 
 
 
544 aa  696  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  71 
 
 
541 aa  788  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  65.53 
 
 
551 aa  708  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0241  AMP-dependent synthetase and ligase  64.56 
 
 
545 aa  645  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276778  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  63.67 
 
 
539 aa  692  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  61.42 
 
 
538 aa  684  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  63.48 
 
 
530 aa  687  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  62.17 
 
 
538 aa  681  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  60.62 
 
 
558 aa  648  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  58.62 
 
 
558 aa  628  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000354199 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  55.33 
 
 
542 aa  625  1e-178  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  56.75 
 
 
576 aa  614  1e-174  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  56.24 
 
 
564 aa  608  1e-172  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  54.95 
 
 
560 aa  603  1e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  55.52 
 
 
564 aa  604  1e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  55.73 
 
 
575 aa  598  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  54.92 
 
 
576 aa  601  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  56.01 
 
 
557 aa  601  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  55.37 
 
 
576 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  55.36 
 
 
575 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  57.51 
 
 
543 aa  596  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  55.56 
 
 
575 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  55.83 
 
 
557 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  55.2 
 
 
575 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  53.51 
 
 
571 aa  592  1e-168  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  55.2 
 
 
575 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  55.7 
 
 
570 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  55.52 
 
 
576 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  55.7 
 
 
576 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  55.91 
 
 
562 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  55.7 
 
 
576 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  55.7 
 
 
564 aa  594  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  55.7 
 
 
576 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  55.52 
 
 
576 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  55.52 
 
 
576 aa  591  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  54.04 
 
 
566 aa  590  1e-167  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  55.04 
 
 
575 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  52.24 
 
 
566 aa  590  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  54.86 
 
 
575 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  55.48 
 
 
557 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  54 
 
 
576 aa  587  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  54.76 
 
 
562 aa  586  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  54.87 
 
 
579 aa  587  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  54.84 
 
 
577 aa  584  1e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  54.59 
 
 
564 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  4.16298e-08 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  55.33 
 
 
565 aa  580  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  55.87 
 
 
539 aa  579  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  53.12 
 
 
570 aa  578  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  53.97 
 
 
571 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  54.97 
 
 
571 aa  580  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17630  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  52.73 
 
 
592 aa  580  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100128  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  52.44 
 
 
576 aa  580  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  54.15 
 
 
571 aa  581  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  52.94 
 
 
574 aa  577  1e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  54.55 
 
 
576 aa  576  1e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  53.32 
 
 
552 aa  575  1e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  52.76 
 
 
570 aa  575  1e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  53.72 
 
 
561 aa  576  1e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  52.57 
 
 
570 aa  573  1e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  51.08 
 
 
562 aa  574  1e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  51.74 
 
 
566 aa  573  1e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  55.27 
 
 
596 aa  575  1e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  52.71 
 
 
570 aa  573  1e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  56.56 
 
 
518 aa  572  1e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  53.29 
 
 
565 aa  571  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  53.5 
 
 
578 aa  571  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  51.07 
 
 
566 aa  570  1e-161  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  53.32 
 
 
578 aa  568  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  53.07 
 
 
578 aa  568  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  53.67 
 
 
560 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  52.08 
 
 
578 aa  569  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  52.77 
 
 
560 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.88335e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  54.37 
 
 
560 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  53.04 
 
 
560 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  50.64 
 
 
558 aa  567  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  51.29 
 
 
570 aa  564  1e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  51.29 
 
 
570 aa  564  1e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  53.18 
 
 
577 aa  563  1e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  51.55 
 
 
573 aa  563  1e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  51.29 
 
 
570 aa  564  1e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  52.91 
 
 
596 aa  563  1e-159  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  51 
 
 
574 aa  558  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  51.88 
 
 
584 aa  559  1e-158  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  53.14 
 
 
601 aa  559  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5975  AMP-binding domain protein  53.76 
 
 
572 aa  561  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1679  AMP-binding domain protein  51.54 
 
 
570 aa  559  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  51.83 
 
 
552 aa  558  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>