More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1334 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10963  glucose-6-phosphate isomerase  74.59 
 
 		 553 aa  832    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4714  glucose-6-phosphate isomerase  76.14 
 
 		 554 aa  852    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  58.06 
 
 		 543 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2589  Glucose-6-phosphate isomerase  58.87 
 
 		 569 aa  645    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0431757  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3338  Glucose-6-phosphate isomerase  73.13 
 
 		 554 aa  817    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1857  glucose-6-phosphate isomerase  75.59 
 
 		 549 aa  843    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145522  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05060  glucose-6-phosphate isomerase  62.16 
 
 		 552 aa  711    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11040  glucose-6-phosphate isomerase  59.82 
 
 		 564 aa  634    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0493698  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0045  glucose-6-phosphate isomerase  60.77 
 
 		 556 aa  650    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  58.17 
 
 		 649 aa  648    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4334  glucose-6-phosphate isomerase  76.32 
 
 		 554 aa  855    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  58.42 
 
 		 543 aa  646    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  59.74 
 
 		 548 aa  647    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  0.00000207698 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1334  Glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 565 aa  1157    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.994679  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2191  Glucose-6-phosphate isomerase  64.23 
 
 		 543 aa  718    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0370  Glucose-6-phosphate isomerase  61.55 
 
 		 561 aa  709    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4420  glucose-6-phosphate isomerase  76.32 
 
 		 554 aa  855    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4877  glucose-6-phosphate isomerase  77.31 
 
 		 553 aa  858    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1463  glucose-6-phosphate isomerase  60.86 
 
 		 561 aa  663    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0410491 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  57.66 
 
 		 546 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3178  glucose-6-phosphate isomerase  57.66 
 
 		 546 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1318  glucose-6-phosphate isomerase  57.25 
 
 		 568 aa  627  1e-178  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.321309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1311  Glucose-6-phosphate isomerase  58.62 
 
 		 560 aa  627  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15279  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0343  glucose-6-phosphate isomerase  55.81 
 
 		 564 aa  627  1e-178  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0183  Glucose-6-phosphate isomerase  57.24 
 
 		 571 aa  619  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0292  glucose-6-phosphate isomerase  58.17 
 
 		 570 aa  618  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7561  glucose-6-phosphate isomerase  58.09 
 
 		 545 aa  615  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  56.54 
 
 		 550 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1025  glucose-6-phosphate isomerase  55.89 
 
 		 566 aa  615  1e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7286  glucose-6-phosphate isomerase  59.15 
 
 		 570 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813116  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0469  glucose-6-phosphate isomerase  54.95 
 
 		 546 aa  600  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  54.84 
 
 		 548 aa  589  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  53.09 
 
 		 547 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2924  glucose-6-phosphate isomerase  52.48 
 
 		 539 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2539  Glucose-6-phosphate isomerase  52.48 
 
 		 539 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  52.27 
 
 		 546 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  53.61 
 
 		 548 aa  570  1e-161  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  53.25 
 
 		 552 aa  567  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  52.55 
 
 		 548 aa  565  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  51.28 
 
 		 567 aa  566  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  51.19 
 
 		 549 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  51.9 
 
 		 562 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  52.89 
 
 		 550 aa  564  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  52.89 
 
 		 550 aa  560  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  53.79 
 
 		 531 aa  560  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  52.79 
 
 		 560 aa  558  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  52.71 
 
 		 550 aa  555  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  51.98 
 
 		 549 aa  555  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  52.71 
 
 		 550 aa  554  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  52.19 
 
 		 552 aa  555  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  51.62 
 
 		 559 aa  552  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23924  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  48.82 
 
 		 554 aa  550  1e-155  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  52.35 
 
 		 550 aa  548  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  50.9 
 
 		 545 aa  547  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  50.45 
 
 		 550 aa  546  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  51.54 
 
 		 548 aa  548  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04050  glucose-6-phosphate isomerase, putative  50.81 
 
 		 556 aa  544  1e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  50.36 
 
 		 549 aa  544  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  51.09 
 
 		 547 aa  541  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  51.54 
 
 		 549 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 545 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  51.09 
 
 		 550 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  49.54 
 
 		 548 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  51.99 
 
 		 541 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  51.54 
 
 		 549 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  51.54 
 
 		 549 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  51.54 
 
 		 549 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  51.36 
 
 		 549 aa  538  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  51.36 
 
 		 549 aa  538  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  51.36 
 
 		 549 aa  538  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  50.99 
 
 		 549 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  50.9 
 
 		 545 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  51.36 
 
 		 549 aa  538  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  50.81 
 
 		 551 aa  535  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  50.81 
 
 		 549 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  49.73 
 
 		 549 aa  537  1e-151  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  50.81 
 
 		 549 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  50.81 
 
 		 549 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  50.45 
 
 		 545 aa  537  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  51.36 
 
 		 549 aa  538  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  50.99 
 
 		 549 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  50.72 
 
 		 545 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  49.45 
 
 		 539 aa  532  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  50.54 
 
 		 548 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  50.54 
 
 		 545 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  50.99 
 
 		 549 aa  532  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  50.54 
 
 		 548 aa  534  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  50.45 
 
 		 545 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  49.64 
 
 		 545 aa  532  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  50.54 
 
 		 548 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  50.18 
 
 		 548 aa  532  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  51.18 
 
 		 545 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  50.63 
 
 		 549 aa  531  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  50.27 
 
 		 545 aa  531  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  50.72 
 
 		 549 aa  530  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  53.31 
 
 		 547 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  48.46 
 
 		 548 aa  528  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  50.27 
 
 		 545 aa  531  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  50.27 
 
 		 549 aa  527  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  51.18 
 
 		 550 aa  527  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>