More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1269 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  100 
 
 		 315 aa  601  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  50.63 
 
 		 312 aa  261  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  46.18 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  41.99 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  42.41 
 
 		 309 aa  198  9e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  42.41 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  41.85 
 
 		 306 aa  196  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  38.66 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  38.02 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  39.1 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  38.34 
 
 		 308 aa  192  6e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  41.03 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  40.38 
 
 		 306 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  40 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  31.65 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  36.86 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  37.18 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  39.37 
 
 		 308 aa  176  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  35.9 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  39.23 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  37.34 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  34.92 
 
 		 322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  38.85 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  37.26 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  40.44 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  38.02 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  37.34 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  38.8 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  36.51 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  37.46 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  37.22 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  37.78 
 
 		 303 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  36.78 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  38.78 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  33.01 
 
 		 315 aa  145  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  36.86 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  37.81 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  36.19 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  38.66 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  33.87 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  37.1 
 
 		 317 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  37.1 
 
 		 317 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  37.46 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  35.06 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  38.32 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  36.77 
 
 		 317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  35.31 
 
 		 319 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  34.91 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  36.1 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  37.92 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  37.58 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  34.29 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  34.18 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  38.08 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  33.97 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  35.87 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  33.87 
 
 		 312 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  37.8 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  37.89 
 
 		 306 aa  133  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  38.78 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  32.91 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  34.67 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  36.08 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  36.19 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  32.15 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  33.87 
 
 		 326 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  30.77 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  37.77 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  35.77 
 
 		 344 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  34.28 
 
 		 323 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  35.11 
 
 		 306 aa  122  8e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  26.6 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  36.12 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  29.64 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  35.67 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  25.08 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  29.32 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  26.91 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  37.11 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  30.28 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  28.25 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  28.25 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  28.25 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0544  ribokinase-like domain-containing protein  32.11 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  32.46 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  26.92 
 
 		 319 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  26.92 
 
 		 319 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  27.92 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  30.25 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  31.02 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  32.8 
 
 		 333 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  34.47 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.86 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  30.65 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  26.37 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  30.65 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  26.69 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  25.72 
 
 		 322 aa  102  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>