209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1268 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1268  Allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 		 219 aa  430  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  48.11 
 
 		 518 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  45.62 
 
 		 531 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  50.52 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  48.94 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  44.44 
 
 		 203 aa  158  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  43.38 
 
 		 539 aa  157  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  45.28 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  46.23 
 
 		 203 aa  155  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  43.52 
 
 		 541 aa  152  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  40 
 
 		 522 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  42.33 
 
 		 553 aa  151  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  46.76 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  46.76 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  46.76 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  43.87 
 
 		 539 aa  148  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  43.06 
 
 		 203 aa  147  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  39.72 
 
 		 549 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  49.43 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  41.63 
 
 		 534 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  39.73 
 
 		 539 aa  144  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  42.22 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  44.7 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  44.19 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  41.12 
 
 		 204 aa  141  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  39.84 
 
 		 248 aa  136  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  58.33 
 
 		 510 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  40.19 
 
 		 536 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  55.88 
 
 		 564 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1378  Allophanate hydrolase subunit 1  49.41 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  39.15 
 
 		 592 aa  127  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  41.8 
 
 		 562 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0593  allophanate hydrolase subunit 1  45.05 
 
 		 234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0362915  normal  0.623241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  46.56 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  47.4 
 
 		 200 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  41.15 
 
 		 555 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10268  hypothetical protein  39.05 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0097  allophanate hydrolase subunit 1  41.25 
 
 		 258 aa  121  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  37.61 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0094  allophanate hydrolase subunit 1  53.54 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  37.21 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  48.24 
 
 		 585 aa  113  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  37.67 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  37.5 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  39.11 
 
 		 253 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  43.06 
 
 		 571 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  39.45 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  36.71 
 
 		 506 aa  108  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  33.49 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  35.65 
 
 		 227 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  34.11 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  34.11 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  34.11 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  34.29 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  34.11 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  41.85 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  34.29 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  34.11 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  34.29 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  34.11 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  34.29 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  35.98 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  34.11 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  33.81 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  41.3 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  41.53 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  41.53 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  34.11 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  41.3 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  41.3 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  41.53 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  41.53 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  41.3 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  34.11 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  37.05 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  35.48 
 
 		 231 aa  105  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  37.8 
 
 		 499 aa  105  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  37.9 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  31.43 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  37.21 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  33.8 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  36.24 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  46.72 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0025  allophanate hydrolase, subunit 1  42.14 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  36.41 
 
 		 201 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  41.3 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  29.02 
 
 		 229 aa  101  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  28.26 
 
 		 243 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  38.64 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  37.22 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1737  allophanate hydrolase subunit 1  32.26 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215551 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  33.8 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  36.67 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  40.38 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0010  allophanate hydrolase subunit 1  32.6 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  31.05 
 
 		 221 aa  100  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  44.27 
 
 		 217 aa  99  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  41.79 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  31.43 
 
 		 218 aa  99  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  32.72 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0629739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>