More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1258 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 381 aa  775    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  77.75 
 
 		 374 aa  598  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  71.16 
 
 		 376 aa  558  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  69.9 
 
 		 375 aa  552  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  69.71 
 
 		 377 aa  552  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  70.51 
 
 		 395 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  69.97 
 
 		 370 aa  550  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  68.24 
 
 		 376 aa  546  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  69.17 
 
 		 371 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  68.18 
 
 		 373 aa  533  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  69.33 
 
 		 370 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  69.33 
 
 		 370 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  69.33 
 
 		 370 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  67.47 
 
 		 370 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  65.7 
 
 		 375 aa  509  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  63.56 
 
 		 373 aa  508  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  65.33 
 
 		 369 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  66.31 
 
 		 376 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  65.68 
 
 		 370 aa  504  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  65.97 
 
 		 374 aa  498  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  66.58 
 
 		 372 aa  494  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  66.58 
 
 		 374 aa  496  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  63.35 
 
 		 377 aa  490  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  60.99 
 
 		 376 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  60.47 
 
 		 376 aa  485  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  63.49 
 
 		 374 aa  461  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  59.06 
 
 		 378 aa  449  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  59.09 
 
 		 417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  58.64 
 
 		 375 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  56.12 
 
 		 372 aa  440  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  58.71 
 
 		 385 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  54.96 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  56.46 
 
 		 393 aa  418  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  54.71 
 
 		 379 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  53.91 
 
 		 380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  58.4 
 
 		 369 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  56.3 
 
 		 378 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  52.28 
 
 		 382 aa  394  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  41.94 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  28.5 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  29.1 
 
 		 352 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  27.3 
 
 		 346 aa  109  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  27.27 
 
 		 357 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  28.61 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  24.86 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  27.32 
 
 		 375 aa  101  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0555  phosphoserine aminotransferase  26.91 
 
 		 410 aa  99.4  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  26.56 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  26.25 
 
 		 360 aa  90.5  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  28.69 
 
 		 357 aa  90.1  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0260  phosphoserine aminotransferase  27.65 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28230  phosphoserine aminotransferase  26.7 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81935  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  25.41 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  26.42 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  26.33 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  27.98 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1351  phosphoserine aminotransferase  27.3 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0019  phosphoserine aminotransferase  27.3 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1759  phosphoserine aminotransferase  25.85 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1381  phosphoserine aminotransferase  26.21 
 
 		 391 aa  82.8  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.705513 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1988  phosphoserine aminotransferase  26.33 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1332  phosphoserine aminotransferase  24.13 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2651  phosphoserine aminotransferase  26.37 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  25.27 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  24.46 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3285  phosphoserine aminotransferase  25.27 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334978  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1464  phosphoserine aminotransferase  24.86 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1324  phosphoserine aminotransferase  25.07 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.308888  normal  0.299596 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  24.19 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  25.8 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3294  phosphoserine aminotransferase  25.27 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.484409  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  25 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0009  phosphoserine aminotransferase  26.79 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  24.18 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3317  phosphoserine aminotransferase  26.6 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  26.29 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2679  phosphoserine aminotransferase  25.9 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0617  phosphoserine aminotransferase  27.44 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4686  phosphoserine aminotransferase  24.4 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0966475  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0903  phosphoserine aminotransferase  25.52 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  24.73 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1270  phosphoserine aminotransferase  25.85 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  25.8 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0508  phosphoserine aminotransferase  24.24 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.957618  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0773  phosphoserine aminotransferase  24.51 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431862  decreased coverage  0.00259178 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  25.98 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3079  phosphoserine aminotransferase  25.07 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  25.74 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1294  phosphoserine aminotransferase  26.08 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303177  normal  0.291609 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3321  phosphoserine aminotransferase  25.07 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  26.92 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1118  phosphoserine aminotransferase  26.3 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.837238  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  25.9 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  25.28 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  24.45 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  24.03 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0563  phosphoserine aminotransferase  25.74 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1042  phosphoserine aminotransferase  25.74 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943212  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0844  phosphoserine aminotransferase  24.23 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.259314  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  26.83 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>