More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1251 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 491 aa  943    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  72.8 
 
 		 486 aa  638    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  62.96 
 
 		 521 aa  565  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  62.96 
 
 		 498 aa  562  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  60.54 
 
 		 488 aa  538  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  64.85 
 
 		 479 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  60.92 
 
 		 470 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.97 
 
 		 471 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.97 
 
 		 471 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.97 
 
 		 471 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  60.08 
 
 		 470 aa  504  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.49 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.73 
 
 		 506 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  53.13 
 
 		 494 aa  473  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.8 
 
 		 491 aa  473  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.39 
 
 		 491 aa  474  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.07 
 
 		 481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  52.24 
 
 		 487 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.45 
 
 		 480 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  53.53 
 
 		 484 aa  462  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.56 
 
 		 507 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.84 
 
 		 463 aa  445  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.63 
 
 		 517 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.91 
 
 		 490 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.89 
 
 		 490 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.22 
 
 		 518 aa  441  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.92 
 
 		 475 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.12 
 
 		 483 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  49.69 
 
 		 502 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  50 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.81 
 
 		 488 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  52.19 
 
 		 496 aa  412  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.26 
 
 		 461 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.57 
 
 		 484 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.27 
 
 		 480 aa  353  5.9999999999999994e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.34 
 
 		 496 aa  351  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.09 
 
 		 465 aa  345  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  43.52 
 
 		 456 aa  320  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.89 
 
 		 456 aa  312  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.31 
 
 		 456 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.5 
 
 		 460 aa  299  9e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.61 
 
 		 442 aa  292  7e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.04 
 
 		 463 aa  276  6e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.5 
 
 		 460 aa  276  9e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.52 
 
 		 440 aa  274  3e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.89 
 
 		 466 aa  273  7e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.38 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.6 
 
 		 442 aa  270  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  34.68 
 
 		 444 aa  268  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.79 
 
 		 441 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.34 
 
 		 431 aa  266  7e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.58 
 
 		 438 aa  265  2e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.05 
 
 		 444 aa  262  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.05 
 
 		 444 aa  262  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.34 
 
 		 462 aa  261  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  33.9 
 
 		 437 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.2 
 
 		 435 aa  259  6e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.61 
 
 		 428 aa  259  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2962  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.35 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.610327  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2421  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.17 
 
 		 443 aa  256  7e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.53 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.52 
 
 		 443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.65 
 
 		 465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0172  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.54 
 
 		 451 aa  254  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000522834  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.14 
 
 		 441 aa  254  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.48 
 
 		 441 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.88 
 
 		 471 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  33.26 
 
 		 429 aa  250  5e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0293  xanthine/uracil permease family protein  33.97 
 
 		 441 aa  249  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.903242  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0321  xanthine/uracil permease family protein  33.76 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000181359  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0255  xanthine/uracil permease family protein  33.76 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  33.76 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5022  xanthine/uracil permease family protein  33.97 
 
 		 441 aa  249  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000757996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0270  xanthine/uracil permease family protein  33.76 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0137601  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03550  permease  36.44 
 
 		 437 aa  248  2e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0244  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  33.76 
 
 		 441 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0302  xanthine/uracil permease family protein  33.97 
 
 		 441 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00487612  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  38.72 
 
 		 430 aa  248  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2522  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.38 
 
 		 438 aa  248  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0248  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.83 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000150063  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.48 
 
 		 454 aa  247  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.73 
 
 		 457 aa  247  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0254  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.97 
 
 		 441 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000390188  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  38.59 
 
 		 430 aa  246  6.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0911  xanthine/uracil permease family protein  36.58 
 
 		 433 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0817  xanthine/uracil permease family protein  36.58 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0295  xanthine/uracil permease family protein  34.05 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0362  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.97 
 
 		 452 aa  245  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00525533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0711  xanthine/uracil permease family protein  36.58 
 
 		 433 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000785311  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0662  xanthine/uracil permease family protein  36.58 
 
 		 433 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0654  xanthine/uracil permease family protein  36.58 
 
 		 433 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000506416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0747  xanthine/uracil permease family protein  36.58 
 
 		 433 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.237802  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.57 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0823  xanthine/uracil permease family protein  36.58 
 
 		 433 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8721299999999997e-52 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2295  xanthine/uracil/vitamin C transporter  35.46 
 
 		 436 aa  244  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0804  xanthine/uracil permease family protein  36.36 
 
 		 433 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1528  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.94 
 
 		 440 aa  242  9e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000884717  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  34.62 
 
 		 429 aa  242  9e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2711  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.54 
 
 		 448 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172353  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0414  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.38 
 
 		 482 aa  242  1e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.222193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>