22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1098 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1098  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  625  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.193091  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2252  hypothetical protein  55.05 
 
 
296 aa  299  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0273  hypothetical protein  50.34 
 
 
336 aa  299  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.747748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0274  hypothetical protein  51.7 
 
 
328 aa  293  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.491507  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4189  hypothetical protein  53.45 
 
 
300 aa  287  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2448  hypothetical protein  48.64 
 
 
319 aa  265  5e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1265  hypothetical protein  51.59 
 
 
298 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486985  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1295  hypothetical protein  41.84 
 
 
281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4188  hypothetical protein  42.86 
 
 
283 aa  200  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4156  hypothetical protein  40.82 
 
 
283 aa  185  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.520818  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1391  hypothetical protein  40.07 
 
 
285 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1693  hypothetical protein  40.07 
 
 
285 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00150047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2259  hypothetical protein  37.14 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300897  normal  0.797835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4200  hypothetical protein  32.62 
 
 
295 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104599  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1946  hypothetical protein  31.72 
 
 
299 aa  136  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.880303  normal  0.0467716 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10293  conserved hypothetical protein  31.37 
 
 
453 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4610  hypothetical protein  31.27 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01187  conserved hypothetical protein  32.12 
 
 
444 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4515  hypothetical protein  29.63 
 
 
283 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.150515  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4207  hypothetical protein  30.88 
 
 
280 aa  99.8  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01835  hypothetical protein  30 
 
 
428 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0088  hypothetical protein  23.24 
 
 
217 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>