60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1070 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1070  Cellulase  100 
 
 
361 aa  726  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00218389  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13180  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  35.59 
 
 
359 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0603055  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.09 
 
 
422 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  36.16 
 
 
323 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6330  Cellulase  34.98 
 
 
326 aa  140  4e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.708114  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  37.31 
 
 
329 aa  135  7e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  37.31 
 
 
329 aa  135  7e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  37.31 
 
 
329 aa  135  7e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  32.98 
 
 
441 aa  136  7e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  36.6 
 
 
341 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  40.71 
 
 
380 aa  135  1e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  38.96 
 
 
439 aa  131  2e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  38.91 
 
 
446 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0518  Cellulase  28.49 
 
 
371 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  31.71 
 
 
437 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  37.32 
 
 
330 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  36.18 
 
 
393 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  40.08 
 
 
870 aa  120  4e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  33.22 
 
 
487 aa  119  8e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  35.69 
 
 
346 aa  119  1e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  36.17 
 
 
491 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  33.92 
 
 
465 aa  116  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1657  glycoside hydrolase family protein  36.59 
 
 
495 aa  115  9e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  31.97 
 
 
438 aa  115  1e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  36.97 
 
 
459 aa  115  2e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  30.1 
 
 
456 aa  113  4e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  34.67 
 
 
469 aa  112  1e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  31.17 
 
 
419 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2132  Cellulase  32.64 
 
 
394 aa  110  4e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4617  cellulase  33.73 
 
 
341 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2131  Cellulase  31.38 
 
 
350 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  28.82 
 
 
469 aa  103  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  30.74 
 
 
448 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  28.27 
 
 
501 aa  92  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3077  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  27.78 
 
 
487 aa  83.2  7e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.45 
 
 
469 aa  80.5  5e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3602  glycoside hydrolase family 6  32.35 
 
 
434 aa  73.2  6e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359346  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  27.87 
 
 
1209 aa  70.9  3e-11  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  25.96 
 
 
611 aa  64.7  2e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  25.62 
 
 
393 aa  62  2e-08  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  25.71 
 
 
623 aa  60.5  5e-08  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 
1128 aa  58.9  1e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1251  fibronectin, type III domain-containing protein  26.29 
 
 
497 aa  54.3  3e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  24.49 
 
 
646 aa  53.5  6e-06  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  25.51 
 
 
605 aa  53.1  7e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  24.36 
 
 
590 aa  52.4  1e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  25.56 
 
 
450 aa  52  2e-05  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  24.36 
 
 
588 aa  52  2e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.45 
 
 
639 aa  51.6  2e-05  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  34.82 
 
 
767 aa  52  2e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  24.12 
 
 
596 aa  52  2e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  37 
 
 
620 aa  50.4  4e-05  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  37 
 
 
589 aa  50.4  5e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  25.66 
 
 
655 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  24.06 
 
 
548 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  24.7 
 
 
743 aa  46.2  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  23.2 
 
 
572 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  32.32 
 
 
791 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35 
 
 
452 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  4.58427e-05  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.77 
 
 
633 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>