63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1063 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1063  secretory lipase  100 
 
 
409 aa  819    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  36.36 
 
 
383 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  35.21 
 
 
427 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  34.75 
 
 
427 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0441069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  33.62 
 
 
385 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  34.49 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  33.73 
 
 
405 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  32.1 
 
 
413 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  29.06 
 
 
410 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  29.06 
 
 
410 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  29.06 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  29.26 
 
 
377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  29.26 
 
 
377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  29.26 
 
 
426 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  30.14 
 
 
346 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2614  secretory lipase  34.07 
 
 
427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  29.94 
 
 
417 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  29.69 
 
 
417 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  29.54 
 
 
375 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  31.2 
 
 
386 aa  99.8  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3330  secretory lipase  30.46 
 
 
407 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  30.17 
 
 
376 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  34.62 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  26.8 
 
 
415 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4826  Triacylglycerol lipase  28.74 
 
 
392 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2256  secretory lipase  37.58 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454748  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  31.27 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  28.31 
 
 
444 aa  79.7  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1963  secretory lipase  36.94 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3126  secretory lipase  29.39 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0242733  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1917  secretory lipase  36.94 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146897  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3821  secretory lipase  25.36 
 
 
420 aa  79  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583502  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0733  putative exported lipase  34.62 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1897  secretory lipase  36.94 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  39.42 
 
 
379 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3922  secretory lipase  35.26 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0253176  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  32.7 
 
 
420 aa  66.6  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02050  Secretory lipase  30.34 
 
 
451 aa  65.1  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0016  secretory lipase  30 
 
 
367 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0760  secretory lipase  25.98 
 
 
468 aa  63.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0030  secretory lipase  31.43 
 
 
442 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0264  secretory lipase  29.14 
 
 
395 aa  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  32.08 
 
 
422 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1356  triacylglycerol lipase  26.15 
 
 
433 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1338  triacylglycerol lipase  26.15 
 
 
433 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  31.45 
 
 
422 aa  62  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1374  triacylglycerol lipase  26.15 
 
 
433 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141016  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0048  Triacylglycerol lipase  28.15 
 
 
432 aa  59.7  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  21.74 
 
 
433 aa  58.9  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0388  Triacylglycerol lipase  29.33 
 
 
422 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3188  Triacylglycerol lipase  23.37 
 
 
464 aa  56.6  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0920741  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  28.93 
 
 
426 aa  50.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11608  hypothetical protein  23.4 
 
 
446 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.166185  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0759  secretory lipase  24.37 
 
 
470 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6867  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  33.59 
 
 
304 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0550  secretory lipase  28.66 
 
 
432 aa  47.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.70438  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1203  secretory lipase  28.89 
 
 
434 aa  47.4  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1828  hypothetical protein  27.32 
 
 
538 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.637727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2796  triacylglycerol lipase  23.12 
 
 
450 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604768  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01799  secretory lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00110)  26.07 
 
 
450 aa  43.5  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0803381  normal  0.696532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3070  triacylglycerol lipase  23.1 
 
 
450 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3087  triacylglycerol lipase  23.1 
 
 
450 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3130  triacylglycerol lipase  23.1 
 
 
450 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.648254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>