More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1039 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1039  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  100 
 
 		 361 aa  717    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  55.46 
 
 		 330 aa  359  4e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0232519  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  54.91 
 
 		 324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  55.04 
 
 		 328 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  54.05 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  53.71 
 
 		 334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  53.71 
 
 		 334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  53.71 
 
 		 334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5339  cytochrome c assembly protein  52.62 
 
 		 326 aa  341  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  52.62 
 
 		 326 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3702  cytochrome c assembly protein  52.62 
 
 		 326 aa  341  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  52.31 
 
 		 324 aa  334  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2820  cytochrome c assembly protein  52.33 
 
 		 326 aa  333  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  50.85 
 
 		 321 aa  308  5.9999999999999995e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  47.9 
 
 		 333 aa  299  6e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  47.56 
 
 		 346 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  43.8 
 
 		 309 aa  259  6e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  43.23 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  50 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  39.16 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.46 
 
 		 330 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.93 
 
 		 339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  42.72 
 
 		 378 aa  216  4e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  41.16 
 
 		 325 aa  212  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.27 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  38.7 
 
 		 320 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4515  cytochrome c assembly protein  40.86 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  38.98 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0824  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.12 
 
 		 357 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.341691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3251  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.04 
 
 		 351 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165529  normal  0.248135 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.51 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.795122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3088  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.77 
 
 		 360 aa  190  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0631  cytochrome c assembly protein  34.54 
 
 		 328 aa  189  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244792  hitchhiker  0.001469 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4471  cytochrome c assembly protein  37.14 
 
 		 366 aa  189  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4302  cytochrome c assembly protein  37.14 
 
 		 366 aa  189  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.694809  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4202  cytochrome c assembly protein  37.14 
 
 		 366 aa  189  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3289  cytochrome c assembly protein  37.12 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8079  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.78 
 
 		 358 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0986266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4574  cytochrome c assembly protein  31.69 
 
 		 360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.05 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.14 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24320  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.29 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909816 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17940  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  35.7 
 
 		 366 aa  178  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.9 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.44 
 
 		 284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0504  cytochrome c assembly protein  36.01 
 
 		 341 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0350668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  39.07 
 
 		 276 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  37.41 
 
 		 283 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  37.13 
 
 		 271 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  34.32 
 
 		 271 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  36.53 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.06 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2731  cytochrome c assembly protein  33.81 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  normal  0.099851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.69 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.95 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.82 
 
 		 271 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.68 
 
 		 282 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  36.15 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.33 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  36.04 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  35.36 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.95 
 
 		 283 aa  146  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  37.24 
 
 		 284 aa  146  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  35.38 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  33.57 
 
 		 278 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  37.6 
 
 		 284 aa  143  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.43 
 
 		 272 aa  142  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0401  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.17 
 
 		 397 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0774  cytochrome c assembly protein  32.72 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  36.67 
 
 		 282 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0113  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.9 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000313165  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.17 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  36.78 
 
 		 283 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  32.27 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  34.22 
 
 		 315 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0666  cytochrome c assembly protein  31.5 
 
 		 463 aa  135  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.74 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  38.19 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.74 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.2 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.79 
 
 		 444 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374119  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0712  cytochrome c assembly protein  30.79 
 
 		 444 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5587  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.13 
 
 		 446 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  34.9 
 
 		 304 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.42 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  30.42 
 
 		 352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  34.29 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  32.56 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.13 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.17 
 
 		 282 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4837  cytochrome c assembly protein  33.21 
 
 		 442 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294706  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  35.16 
 
 		 318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0986  cytochrome c assembly protein  30.42 
 
 		 444 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.01 
 
 		 282 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1199  cytochrome c assembly protein  26.39 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1600  resC protein  26.74 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254152  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.56 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2220  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.42 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1636  resC protein  26.74 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0783645  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.8 
 
 		 310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>