210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0959 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 		 206 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  43.14 
 
 		 200 aa  138  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.17 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  43.41 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.72 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0575  peptidase S16, lon-like protein  40.69 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0587  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.69 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0565  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.69 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.76 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  33.86 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  37.93 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  36.22 
 
 		 226 aa  91.7  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  38.35 
 
 		 196 aa  88.2  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  35.5 
 
 		 225 aa  85.5  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  33.85 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  40.61 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  44.04 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  33.49 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  50.55 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  36.89 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  33.82 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  40.58 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.21 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.55 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.49 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  47.37 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  34.63 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  31.46 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  31.46 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  33.02 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  36.22 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  34.12 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  46.81 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  31.63 
 
 		 220 aa  72  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.74 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  31.63 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.15 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  31.7 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  44.33 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.6 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  30.59 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.38 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.3 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.48 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.99 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05961  ATP-dependent protease (CrgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10470)  29.86 
 
 		 623 aa  66.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.870505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  32.37 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  39.83 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  31.91 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  27.6 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  29.52 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  34.21 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.6 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.31 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  27.7 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  30.49 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  42.57 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  29.79 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  35.55 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  38.71 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  30.16 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  29.05 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  34.6 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.41 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.5 
 
 		 231 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.02 
 
 		 234 aa  62  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  30.43 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  28.57 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  31.98 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  29.59 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  38.38 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  28.44 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.47 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  29.9 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  31.25 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  30.93 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  40 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.87 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  29.95 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  45.56 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  25.12 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.43 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  43.62 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  48.35 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  31.12 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.86 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  31.34 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5613  peptidase S16 lon domain protein  34.34 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.56 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  24.87 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  28.86 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.73 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  30.41 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  30.29 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  22.27 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.29 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.29 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  29.13 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.73 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.73 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>