135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0885 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  100 
 
 		 333 aa  676    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  62.46 
 
 		 324 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  63.08 
 
 		 318 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  63.08 
 
 		 318 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  64.56 
 
 		 317 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  65.55 
 
 		 311 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  63.69 
 
 		 317 aa  413  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  58.66 
 
 		 322 aa  351  8.999999999999999e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  52.55 
 
 		 315 aa  295  6e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  52.34 
 
 		 305 aa  278  7e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  47.95 
 
 		 319 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  45.89 
 
 		 312 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  41.48 
 
 		 319 aa  206  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  37.83 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0059  hypothetical protein  46.43 
 
 		 173 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2789  hypothetical protein  44.64 
 
 		 177 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.705189  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  46.21 
 
 		 132 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  40.5 
 
 		 143 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  38.14 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  34.75 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  35.94 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  38.81 
 
 		 138 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  34.13 
 
 		 138 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  35.21 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  33.61 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  31.97 
 
 		 137 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  35.78 
 
 		 133 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  36.72 
 
 		 141 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  40.35 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  31.16 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  38.46 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  33.05 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  35.83 
 
 		 131 aa  62.4  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  37.19 
 
 		 130 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  31.36 
 
 		 137 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  38.53 
 
 		 144 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  36.67 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  34.19 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  38.66 
 
 		 142 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  34.51 
 
 		 140 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  32.43 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  31.03 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  34.19 
 
 		 541 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  29.06 
 
 		 137 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  35.04 
 
 		 550 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  35.04 
 
 		 550 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  33.05 
 
 		 139 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  43.48 
 
 		 134 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  32.82 
 
 		 131 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  33.85 
 
 		 140 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  31.62 
 
 		 132 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  30.95 
 
 		 142 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  31.15 
 
 		 548 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  35.04 
 
 		 550 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  28.43 
 
 		 147 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  34.94 
 
 		 130 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  29.55 
 
 		 150 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  34.11 
 
 		 145 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  29.55 
 
 		 150 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  31.15 
 
 		 548 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  34.34 
 
 		 134 aa  53.9  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  31.21 
 
 		 148 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  29.93 
 
 		 132 aa  53.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  48.57 
 
 		 148 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  28.79 
 
 		 150 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  32.43 
 
 		 143 aa  52.8  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  29.93 
 
 		 132 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  43.86 
 
 		 149 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  32.14 
 
 		 130 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  34.04 
 
 		 136 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  30.51 
 
 		 147 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  43.33 
 
 		 153 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  32.48 
 
 		 135 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  47.83 
 
 		 149 aa  50.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  31.67 
 
 		 138 aa  50.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  39.81 
 
 		 152 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  32.26 
 
 		 151 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  45.9 
 
 		 121 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  32.33 
 
 		 151 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  32.53 
 
 		 130 aa  49.3  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  34.57 
 
 		 129 aa  49.3  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  29.91 
 
 		 137 aa  49.3  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  27.41 
 
 		 147 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  46.67 
 
 		 144 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  46.67 
 
 		 144 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  29.27 
 
 		 132 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  46.67 
 
 		 144 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  30.95 
 
 		 135 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  28.95 
 
 		 149 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  32.17 
 
 		 132 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  44.32 
 
 		 145 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  44.32 
 
 		 145 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  44.32 
 
 		 145 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  30.43 
 
 		 133 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  40 
 
 		 158 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>