223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0877 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0877  MaoC domain protein dehydratase  100 
 
 
148 aa  296  4e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4775  MaoC domain protein dehydratase  47.83 
 
 
153 aa  130  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2195  MaoC domain protein dehydratase  39.73 
 
 
161 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.300893 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1872  MaoC domain protein dehydratase  38.36 
 
 
161 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0980  MaoC-like dehydratase  40.82 
 
 
147 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4342  MaoC domain protein dehydratase  42.67 
 
 
180 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.482582 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2522  MaoC domain-containing protein  38.85 
 
 
142 aa  100  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0109076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0028  dehydratase  38.85 
 
 
142 aa  100  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0028  dehydratase  38.85 
 
 
142 aa  100  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2320  MaoC domain protein dehydratase  41.04 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0946  MaoC-like dehydratase  42.38 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0349  MaoC domain protein dehydratase  40.3 
 
 
152 aa  97.4  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0671  hypothetical protein  34.48 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3190  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  36.84 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1455  MoaC domain-containing protein  36.03 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3813  MaoC domain protein dehydratase  40.54 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3961  MaoC domain protein dehydratase  45.38 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1309  MoaC domain-containing protein  36.03 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1318  MoaC domain-containing protein  36.03 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233645  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1990  dehydratase  36.11 
 
 
152 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  normal  0.551066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1364  MaoC domain protein dehydratase  37.86 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362364  hitchhiker  0.00124246 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2043  hypothetical protein  43.3 
 
 
156 aa  92  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.770796  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2253  dehydratase  35.48 
 
 
160 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350029  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1810  MoaC domain-containing protein  35.29 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0727  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1080  MoaC domain-containing protein  37.5 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1149  MoaC domain-containing protein  35.29 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.58838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0718  MoaC domain-containing protein  35.29 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0432  MoaC domain-containing protein  35.29 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1191  MaoC-like dehydratase  36.24 
 
 
149 aa  90.1  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1618  MaoC-like dehydratase  37.5 
 
 
167 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2230  dehydratase  37.5 
 
 
167 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2254  dehydratase  37.5 
 
 
153 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1047  dehydratase  36.03 
 
 
153 aa  87  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0118845  normal  0.124515 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2147  dehydratase  35.29 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159813  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2796  MaoC domain protein dehydratase  36.3 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2268  dehydratase  35.29 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3454  MaoC domain protein dehydratase  36.05 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0047  dehydratase  36.67 
 
 
157 aa  84  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_004310  BR1539  maoC-related protein  35.57 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.250749  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0047  MaoC domain protein dehydratase  33.12 
 
 
152 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4156  MaoC-like dehydratase  35 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.717491  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1627  dehydratase  34 
 
 
160 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350519  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1473  dehydratase  33.78 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5558  MaoC-like dehydratase  33.82 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2396  dehydratase  35.48 
 
 
334 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0902471  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0096  MaoC domain protein dehydratase  36.43 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2815  MaoC domain protein dehydratase  38.19 
 
 
334 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846625  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6277  MaoC domain protein dehydratase  28.68 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3996  MaoC-like dehydratase  34.38 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0169  dehydratase  34.07 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0997526  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5482  dehydratase  37.84 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2414  MaoC domain protein dehydratase  35.25 
 
 
332 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2161  MaoC-like dehydratase  39.86 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2490  MaoC domain protein dehydratase  37.12 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3209  MaoC domain protein dehydratase  35.37 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0647415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2486  dehydratase  34.53 
 
 
352 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3664  dehydratase  35.88 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1538  maoC-related protein  33.8 
 
 
166 aa  77  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0790227  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1628  dehydratase  34.04 
 
 
161 aa  77  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.584563  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1662  dehydratase  39.57 
 
 
146 aa  77  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0495  dehydratase  36.96 
 
 
146 aa  77  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2125  MaoC-like dehydratase  33.78 
 
 
152 aa  77  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.133316  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2774  MaoC domain protein dehydratase  34.46 
 
 
155 aa  76.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.664287  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2601  dehydratase  33.56 
 
 
154 aa  77  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.801484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2709  MaoC domain protein dehydratase  33.81 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0849  MaoC-like dehydratase  34.25 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1487  maoC-related protein  35.61 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4164  MaoC domain protein dehydratase  37.67 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3037  MaoC domain protein dehydratase  35.86 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667967  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3196  hypothetical protein  35.14 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2600  dehydratase  37.61 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2194  MaoC-like dehydratase  35.14 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0225  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4835  MaoC domain protein dehydratase  30.38 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2773  MaoC domain protein dehydratase  34.97 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377896  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2976  dehydratase  32.65 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1390  dehydratase  31.79 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3698  MaoC-related protein  34.09 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.27276  normal  0.530433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18160  hypothetical protein  33.56 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1772  hypothetical protein  33.12 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4123  dehydratase  37.4 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05499  hypothetical protein  35.42 
 
 
165 aa  72  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2507  MaoC-like dehydratase  32.91 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2160  MaoC-like dehydratase  31.25 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3543  MaoC-like dehydratase  34.67 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.925592  normal  0.245974 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3038  MaoC domain protein dehydratase  36.24 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.724485  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0620  MaoC-like dehydratase  34.93 
 
 
157 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2249  dehydratase  32.41 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  0.226342 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4680  dehydratase  38.14 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314725  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3098  MaoC-like dehydratase  31.21 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2254  dehydratase  29.93 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.437437  normal  0.402982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1420  MaoC-like dehydratase  29.75 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.788165  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0800  MaoC domain-containing protein dehydratase  33.01 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2070  dehydratase  33.98 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1835  MaoC domain protein dehydratase  35.04 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0897261  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3197  hypothetical protein  34.59 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440702  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3099  MaoC-like dehydratase  29.58 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4157  MaoC-like dehydratase  28.57 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.967717  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2268  dehydratase  27.78 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.276096  normal  0.630961 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2604  dehydratase  38.74 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.836976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>