More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0863 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
282 aa  568  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  57.72 
 
 
294 aa  311  4.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  55.32 
 
 
296 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  60.08 
 
 
289 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  55.32 
 
 
296 aa  291  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  52.07 
 
 
307 aa  289  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  60.3 
 
 
291 aa  288  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  55.4 
 
 
301 aa  287  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  54.96 
 
 
296 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  54.26 
 
 
309 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.65 
 
 
297 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  50.91 
 
 
290 aa  268  8.999999999999999e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  55.02 
 
 
293 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0752  enoyl-CoA hydratase  49.28 
 
 
298 aa  249  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.620367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2021  enoyl-CoA hydratase  50.18 
 
 
299 aa  241  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1011  enoyl-CoA hydratase  48.35 
 
 
295 aa  240  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  44.73 
 
 
291 aa  229  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  43.77 
 
 
292 aa  228  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4488  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.35 
 
 
290 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  46.9 
 
 
285 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3638  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.37 
 
 
293 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  46.9 
 
 
285 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  46.9 
 
 
285 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  43.21 
 
 
288 aa  208  8e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1856  enoyl-CoA hydratase  40.73 
 
 
288 aa  188  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 
274 aa  176  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00370  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01890)  40 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.526484  normal  0.612902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  38.27 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 
269 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 
281 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 
276 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 
281 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.74 
 
 
257 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
275 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 
270 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 
282 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
279 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  35.53 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.42 
 
 
271 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  37.02 
 
 
270 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.44 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.91 
 
 
281 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  36.7 
 
 
270 aa  145  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 
275 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.12 
 
 
262 aa  145  9e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.86 
 
 
269 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 
267 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.32 
 
 
271 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
275 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  35.98 
 
 
270 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  37.15 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.72 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 
257 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 
260 aa  139  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.47 
 
 
262 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  34.88 
 
 
280 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  37.36 
 
 
261 aa  135  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 
269 aa  135  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.69 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
262 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1904  enoyl-CoA hydratase  35.96 
 
 
272 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526145  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 
260 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  37.93 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  32.2 
 
 
266 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  38.64 
 
 
261 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.67 
 
 
264 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  33.72 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.37 
 
 
273 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  30.12 
 
 
262 aa  129  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  34.59 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
265 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 
266 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
266 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
260 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
264 aa  125  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
251 aa  125  8.000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 
267 aa  125  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4163  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.72 
 
 
248 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.941221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>