More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0858 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  100 
 
 
201 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  50.48 
 
 
215 aa  205  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  50.48 
 
 
215 aa  205  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  50.48 
 
 
215 aa  205  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  54.36 
 
 
211 aa  191  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  45.45 
 
 
201 aa  159  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
205 aa  124  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 
205 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  38.42 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  41.52 
 
 
202 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
225 aa  114  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 
198 aa  108  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  37.07 
 
 
192 aa  107  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
197 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  34.01 
 
 
234 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  41.11 
 
 
196 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  39.49 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  34.02 
 
 
196 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  40.53 
 
 
194 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  36.42 
 
 
192 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 
195 aa  88.2  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
196 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  42.74 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
197 aa  77.8  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
198 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
198 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  37.01 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  27.23 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 
212 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
210 aa  63.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
187 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
219 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  57.89 
 
 
209 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 
205 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  32.41 
 
 
246 aa  58.2  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 
200 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 
217 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  50 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
186 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 
239 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 
219 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 
211 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
206 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1567  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
261 aa  55.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
221 aa  55.1  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  35.45 
 
 
219 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 
309 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
207 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 
223 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
191 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 
188 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
211 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 
243 aa  55.1  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.44 
 
 
217 aa  54.7  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 
212 aa  54.7  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  31.48 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.48 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  31.48 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.48 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal 
 
 
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NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 
310 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.48 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  28.7 
 
 
242 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.48 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.48 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal 
 
 
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NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.48 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal 
 
 
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NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  34.31 
 
 
213 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal 
 
 
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NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 
307 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  43.55 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
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