203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0857 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0857  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  100 
 
 		 294 aa  577  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00184237  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5169  alpha/beta hydrolase fold  50.88 
 
 		 281 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5258  alpha/beta hydrolase fold  50.88 
 
 		 281 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5550  alpha/beta hydrolase fold  50.53 
 
 		 281 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5694  alpha/beta hydrolase fold protein  50.37 
 
 		 285 aa  239  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10077  oxidoreductase  36.3 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2003  alpha/beta hydrolase fold protein  38.21 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0706427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5672  alpha/beta hydrolase fold protein  37.86 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2923  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  36.26 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3765  alpha/beta hydrolase fold protein  35.74 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00546797  normal  0.0830627 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1124  hydrolase/oxidase  30.71 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5305  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640816  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5394  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.117784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5684  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4132  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5859  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 274 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3236  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21765  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  36.8 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.904982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  28.04 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  23.16 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1443  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  29.86 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4425  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  21.25 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2524  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191212  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3137  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  27.72 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  21.94 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4900  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000488276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3497  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  29.01 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  23.93 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  24.91 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  20.88 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  28.24 
 
 		 324 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  28.24 
 
 		 324 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3153  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0769848 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  28.24 
 
 		 324 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 405 aa  52.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 277 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  22.66 
 
 		 278 aa  53.1  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  28.24 
 
 		 327 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  20.88 
 
 		 279 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  20.88 
 
 		 279 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  20.88 
 
 		 279 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  20.88 
 
 		 279 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  20.88 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  24.56 
 
 		 275 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  26.3 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  20.88 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  28.24 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  24.9 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6254  alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3192  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  19.85 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5750  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  24.46 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  26.28 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  21.75 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  20.51 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.71 
 
 		 372 aa  49.7  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  28.03 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  28.03 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1480  Alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 304 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000123975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  24.01 
 
 		 335 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 275 aa  49.3  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 320 aa  49.3  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  25.49 
 
 		 328 aa  48.9  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  21.02 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  22.68 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  35.11 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  24.32 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3040  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4272  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>