More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0827 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
706 aa  1387    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  67.77 
 
 
706 aa  871    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  52.05 
 
 
679 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.31 
 
 
704 aa  552  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  49.79 
 
 
724 aa  548  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.42 
 
 
691 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.42 
 
 
691 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.75 
 
 
712 aa  545  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.13 
 
 
691 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.4 
 
 
723 aa  535  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.57 
 
 
979 aa  534  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.97 
 
 
689 aa  535  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.35 
 
 
706 aa  526  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  48.91 
 
 
691 aa  527  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.56 
 
 
788 aa  527  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.59 
 
 
734 aa  524  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.81 
 
 
718 aa  522  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.58 
 
 
754 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.05 
 
 
713 aa  518  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  48.28 
 
 
691 aa  515  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  51.95 
 
 
766 aa  504  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.97 
 
 
712 aa  501  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.46 
 
 
708 aa  498  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.79 
 
 
745 aa  498  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.86 
 
 
729 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.78 
 
 
733 aa  493  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.27 
 
 
762 aa  488  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.18 
 
 
749 aa  487  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.34 
 
 
708 aa  485  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.7 
 
 
714 aa  485  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.36 
 
 
697 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.03 
 
 
756 aa  473  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.82 
 
 
698 aa  452  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.38 
 
 
693 aa  452  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.94 
 
 
741 aa  446  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.68 
 
 
695 aa  446  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.9 
 
 
756 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.62 
 
 
698 aa  435  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.82 
 
 
698 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.68 
 
 
699 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.58 
 
 
697 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.83 
 
 
698 aa  415  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.51 
 
 
693 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.63 
 
 
691 aa  391  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.9 
 
 
691 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.2 
 
 
543 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.2 
 
 
543 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.2 
 
 
543 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.22 
 
 
602 aa  210  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.14 
 
 
448 aa  209  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.77 
 
 
1376 aa  208  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.08 
 
 
624 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.33 
 
 
556 aa  197  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.8 
 
 
545 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  37.72 
 
 
597 aa  191  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.6 
 
 
535 aa  191  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.36 
 
 
562 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.24 
 
 
592 aa  189  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.33 
 
 
599 aa  188  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.84 
 
 
593 aa  187  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.84 
 
 
593 aa  187  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.98 
 
 
708 aa  187  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.67 
 
 
599 aa  187  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.47 
 
 
606 aa  187  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.37 
 
 
714 aa  186  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.43 
 
 
451 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.52 
 
 
646 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  33.52 
 
 
493 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.08 
 
 
552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.63 
 
 
707 aa  185  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.53 
 
 
634 aa  184  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.19 
 
 
599 aa  183  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35 
 
 
592 aa  183  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.34 
 
 
606 aa  182  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.43 
 
 
731 aa  182  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.5 
 
 
607 aa  182  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  30.55 
 
 
588 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.74 
 
 
607 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.84 
 
 
603 aa  181  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.48 
 
 
607 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.83 
 
 
590 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.47 
 
 
705 aa  180  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.47 
 
 
705 aa  180  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1335  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 
592 aa  180  7e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.764051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.74 
 
 
718 aa  180  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.49 
 
 
607 aa  179  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  36.68 
 
 
705 aa  179  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  36.16 
 
 
705 aa  179  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.56 
 
 
600 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0459  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.36 
 
 
618 aa  179  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.68 
 
 
705 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4412  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.97 
 
 
619 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659664  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.66 
 
 
557 aa  178  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.36 
 
 
705 aa  178  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18280  predicted protein  31.8 
 
 
504 aa  178  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.06 
 
 
705 aa  178  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.36 
 
 
705 aa  178  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.76 
 
 
709 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0181  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.61 
 
 
705 aa  178  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.566747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.66 
 
 
705 aa  178  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>