More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0756 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  100 
 
 
207 aa  423  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3665  Methyltransferase type 11  52.71 
 
 
251 aa  202  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  39.51 
 
 
247 aa  124  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  37.35 
 
 
236 aa  99  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1338  Methyltransferase type 11  34.01 
 
 
249 aa  95.9  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00439312  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  35.58 
 
 
235 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  35.58 
 
 
235 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  35.58 
 
 
235 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0738  methyltransferase type 11  35.76 
 
 
236 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  35.57 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  38.62 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  44.55 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  40.21 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1903  methyltransferase type 11  29.47 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000234501  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0952  methyltransferase type 11  32.12 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.82 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2114  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.420703  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  34.88 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.2 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  34.18 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.05 
 
 
225 aa  72  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  35.15 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  41.53 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2712  putative phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.97 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870029  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.05 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.59 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0964  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.53 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417338  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  31.98 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2733  methyltransferase type 11  33.57 
 
 
506 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122913  normal  0.460433 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.31 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.31 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  38.98 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  32.91 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  39.45 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.95 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1467  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.72 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.19 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.17 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1755  methyltransferase type 11  31.18 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.6 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
269 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2700  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
274 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  30.3 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  39.8 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  33.77 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.7 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.38 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  40.57 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  32.87 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  33 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  31.1 
 
 
357 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.51 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.51 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.5 
 
 
229 aa  64.7  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2020  methyltransferase type 11  30.37 
 
 
230 aa  64.3  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.14 
 
 
229 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.76 
 
 
351 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  32.93 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
272 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.75 
 
 
296 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.93 
 
 
244 aa  63.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.25 
 
 
201 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.04 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  26.82 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.08 
 
 
237 aa  63.2  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  37 
 
 
270 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  28.99 
 
 
265 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.08 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  36.45 
 
 
261 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.41 
 
 
204 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.54 
 
 
280 aa  62.4  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  37.21 
 
 
268 aa  62.4  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2418  Methyltransferase type 11  38.02 
 
 
216 aa  62  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.224648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
201 aa  62.4  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
271 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0176  hypothetical protein  37.27 
 
 
279 aa  62  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261727  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.5 
 
 
250 aa  62  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  34.48 
 
 
247 aa  62  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  29.52 
 
 
235 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.82 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.179715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>