112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0740 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  100 
 
 		 618 aa  1231    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  62.1 
 
 		 475 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  40.1 
 
 		 579 aa  262  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  28.09 
 
 		 593 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  28.02 
 
 		 601 aa  124  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  28.06 
 
 		 593 aa  122  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  28.21 
 
 		 581 aa  122  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  28.06 
 
 		 593 aa  122  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  28.21 
 
 		 581 aa  122  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  33.46 
 
 		 567 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  32.43 
 
 		 484 aa  117  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  33.74 
 
 		 511 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  33.74 
 
 		 488 aa  109  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  36.68 
 
 		 524 aa  94.7  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  39.91 
 
 		 519 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  30.51 
 
 		 550 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  38.99 
 
 		 517 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  37.22 
 
 		 535 aa  88.2  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  30.59 
 
 		 582 aa  87.4  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  31.38 
 
 		 571 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  29.26 
 
 		 546 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  31.68 
 
 		 480 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  29.72 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  28.82 
 
 		 586 aa  84.3  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  31.68 
 
 		 480 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  31.68 
 
 		 480 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  32.58 
 
 		 578 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  30.35 
 
 		 514 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  30.22 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  30.11 
 
 		 578 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  30.35 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  30.11 
 
 		 578 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  30.35 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  32.58 
 
 		 578 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  30.31 
 
 		 512 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  31.13 
 
 		 508 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  31.13 
 
 		 508 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  30.17 
 
 		 539 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  32.03 
 
 		 519 aa  73.9  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  33.16 
 
 		 491 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  33.16 
 
 		 491 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  27.48 
 
 		 506 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  35.04 
 
 		 566 aa  73.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  33.16 
 
 		 516 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  30.9 
 
 		 550 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  30.24 
 
 		 601 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  32.62 
 
 		 491 aa  71.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  36.2 
 
 		 519 aa  70.9  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  40 
 
 		 532 aa  70.5  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  35.14 
 
 		 441 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  42.47 
 
 		 360 aa  70.5  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  28.17 
 
 		 516 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  47.76 
 
 		 620 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  39.78 
 
 		 620 aa  64.7  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  41.98 
 
 		 502 aa  63.9  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  40 
 
 		 521 aa  62  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  44 
 
 		 561 aa  61.2  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  40.66 
 
 		 714 aa  60.1  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  36.28 
 
 		 3471 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  36.28 
 
 		 3472 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  42.67 
 
 		 577 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  40 
 
 		 566 aa  58.9  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 748 aa  57.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  37.63 
 
 		 743 aa  58.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  35.85 
 
 		 603 aa  57  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  36.04 
 
 		 3521 aa  57  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  40 
 
 		 620 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 580 aa  56.6  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  40.51 
 
 		 427 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  38.57 
 
 		 568 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  39.73 
 
 		 516 aa  55.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  35.85 
 
 		 926 aa  54.7  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  34.34 
 
 		 637 aa  55.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 558 aa  55.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 580 aa  54.7  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  31.54 
 
 		 535 aa  54.3  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  37.14 
 
 		 585 aa  54.3  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  42.65 
 
 		 709 aa  54.3  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  40.3 
 
 		 535 aa  54.3  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  41.27 
 
 		 510 aa  54.3  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  38.81 
 
 		 499 aa  53.9  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  39.24 
 
 		 434 aa  53.9  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  40 
 
 		 512 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  38.81 
 
 		 605 aa  53.5  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  36.11 
 
 		 584 aa  53.9  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  25.87 
 
 		 567 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  40 
 
 		 553 aa  52.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  46.67 
 
 		 444 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  38.89 
 
 		 3409 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  38.27 
 
 		 523 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  50 
 
 		 489 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  35.05 
 
 		 498 aa  51.2  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  31.18 
 
 		 530 aa  51.2  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 551 aa  50.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  36.26 
 
 		 602 aa  50.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3886  hypothetical protein  44.12 
 
 		 554 aa  50.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00540166  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  36.92 
 
 		 556 aa  48.5  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  34.82 
 
 		 423 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  36.47 
 
 		 630 aa  47.8  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  36.92 
 
 		 507 aa  47.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>