61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0733 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0733  putative exported lipase  100 
 
 
397 aa  794    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  58.9 
 
 
388 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0264  secretory lipase  58.78 
 
 
395 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1897  secretory lipase  58.86 
 
 
382 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1917  secretory lipase  58.86 
 
 
399 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146897  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1963  secretory lipase  58.86 
 
 
399 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  53.42 
 
 
379 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3922  secretory lipase  53.42 
 
 
366 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0253176  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2256  secretory lipase  53.41 
 
 
397 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454748  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  40 
 
 
400 aa  212  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  37.17 
 
 
376 aa  192  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  33.24 
 
 
417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  33.33 
 
 
386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  35.77 
 
 
427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0441069 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  35.33 
 
 
427 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2614  secretory lipase  36.59 
 
 
427 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  32.68 
 
 
376 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  33.33 
 
 
410 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  33.06 
 
 
410 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  33.06 
 
 
410 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3330  secretory lipase  34.14 
 
 
407 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  32.76 
 
 
346 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  31.61 
 
 
426 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  31.61 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  31.61 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  30.46 
 
 
375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  28.77 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  30.43 
 
 
413 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3821  secretory lipase  28.69 
 
 
420 aa  96.3  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583502  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  29.94 
 
 
433 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  42.2 
 
 
383 aa  89.4  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  28.02 
 
 
444 aa  83.6  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  25.68 
 
 
417 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3126  secretory lipase  27.27 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0242733  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4826  Triacylglycerol lipase  29.2 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02050  Secretory lipase  34.36 
 
 
451 aa  74.7  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  32.2 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  31.85 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2422  putative exported lipase  34.96 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0550  secretory lipase  28.07 
 
 
432 aa  69.7  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.70438  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0388  Triacylglycerol lipase  25.69 
 
 
422 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0030  secretory lipase  27.19 
 
 
442 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1374  triacylglycerol lipase  34.4 
 
 
433 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141016  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1356  triacylglycerol lipase  34.4 
 
 
433 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1338  triacylglycerol lipase  34.4 
 
 
433 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1203  secretory lipase  31.16 
 
 
434 aa  61.2  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0465  secretory lipase  31.72 
 
 
439 aa  56.2  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  28.35 
 
 
426 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0016  secretory lipase  27.63 
 
 
367 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1063  secretory lipase  34.62 
 
 
409 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0759  secretory lipase  26.25 
 
 
470 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  26.77 
 
 
422 aa  49.7  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  25.71 
 
 
424 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  25.71 
 
 
424 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  26.77 
 
 
422 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  26.24 
 
 
398 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  24.44 
 
 
321 aa  47  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2177  hypothetical protein  26.99 
 
 
412 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0642236  normal  0.0211991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6873  hypothetical protein  26.44 
 
 
401 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.358007  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  25.6 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3255  hypothetical protein  27.04 
 
 
404 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.217515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>