More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0660 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  100 
 
 		 200 aa  407  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  74.5 
 
 		 198 aa  302  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  69.19 
 
 		 197 aa  290  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  70.71 
 
 		 197 aa  287  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  70.71 
 
 		 197 aa  279  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  70.71 
 
 		 197 aa  279  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  70.71 
 
 		 197 aa  279  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  68.18 
 
 		 197 aa  278  4e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  64 
 
 		 195 aa  251  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  62.12 
 
 		 190 aa  246  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  65.26 
 
 		 183 aa  243  9e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  53.54 
 
 		 190 aa  194  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  55.56 
 
 		 190 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  52.78 
 
 		 192 aa  177  7e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  47.83 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  48.24 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  50.84 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  51.19 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  52.81 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  48.07 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  46.15 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  47.19 
 
 		 230 aa  134  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  44.57 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  42.05 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  42.78 
 
 		 181 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  43.09 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  49.39 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  43.46 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  40.88 
 
 		 180 aa  124  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  45 
 
 		 204 aa  123  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  44.13 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  49.15 
 
 		 178 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  48.15 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  44.07 
 
 		 162 aa  121  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  40.78 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  50 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  46.11 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  41.99 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  42.78 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  47.27 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  37.81 
 
 		 186 aa  115  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  38.2 
 
 		 162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  39.62 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  42.07 
 
 		 154 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  41.67 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  40.78 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  36.95 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  41.81 
 
 		 173 aa  111  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  40.76 
 
 		 162 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  38.2 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  43.56 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  40.33 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  41.44 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  41.48 
 
 		 161 aa  109  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  39.01 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  39.44 
 
 		 162 aa  108  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  39.88 
 
 		 167 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  40.56 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  39.26 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  39.88 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  41.61 
 
 		 150 aa  104  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  40.88 
 
 		 199 aa  104  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  37.57 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  43.37 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  35.56 
 
 		 181 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  37.81 
 
 		 181 aa  101  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  42.68 
 
 		 176 aa  101  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  42.33 
 
 		 162 aa  101  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  40.37 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  36.96 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  39.53 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  38.51 
 
 		 164 aa  99.4  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  40.24 
 
 		 155 aa  99.4  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  40.99 
 
 		 177 aa  99  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  40.56 
 
 		 164 aa  97.4  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  39.89 
 
 		 170 aa  97.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  39.89 
 
 		 170 aa  97.4  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  38.37 
 
 		 208 aa  95.9  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  36 
 
 		 164 aa  96.3  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  40.49 
 
 		 173 aa  95.9  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  39.62 
 
 		 177 aa  94.7  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  39.26 
 
 		 189 aa  94.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  38.55 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  37.8 
 
 		 171 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  36.31 
 
 		 172 aa  93.6  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  38.55 
 
 		 170 aa  93.6  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  37.79 
 
 		 178 aa  92.8  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  36.87 
 
 		 171 aa  92.8  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  36 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  38.12 
 
 		 169 aa  92.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  37.78 
 
 		 169 aa  92.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1501  peptide deformylase  41.3 
 
 		 174 aa  92  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  38.71 
 
 		 169 aa  92  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  37.99 
 
 		 170 aa  92  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  37.2 
 
 		 171 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  38.41 
 
 		 157 aa  91.7  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  37.8 
 
 		 167 aa  90.9  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  37.65 
 
 		 156 aa  90.9  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  36.36 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  38.27 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>