More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0494 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  53.73 
 
 
816 aa  822    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  53.38 
 
 
830 aa  777    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  55.38 
 
 
818 aa  864    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
816 aa  1662    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  53.25 
 
 
831 aa  775    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  53.85 
 
 
816 aa  821    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  55.16 
 
 
810 aa  818    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  54.03 
 
 
824 aa  790    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  60.91 
 
 
840 aa  1005    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  53.25 
 
 
831 aa  775    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  53.85 
 
 
816 aa  821    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  54.03 
 
 
828 aa  795    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  54.24 
 
 
817 aa  842    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  45.66 
 
 
830 aa  653    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  44.29 
 
 
693 aa  534  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  41.64 
 
 
720 aa  496  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.67 
 
 
761 aa  467  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  34.21 
 
 
814 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  35.81 
 
 
726 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  33.79 
 
 
773 aa  328  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  33.17 
 
 
789 aa  323  8e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.47 
 
 
695 aa  319  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  33.7 
 
 
880 aa  318  4e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  32.67 
 
 
801 aa  317  5e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  33.71 
 
 
871 aa  312  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 
819 aa  304  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
807 aa  300  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  33.72 
 
 
758 aa  294  4e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  33.81 
 
 
680 aa  287  7e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  32.95 
 
 
721 aa  285  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
758 aa  284  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.31 
 
 
747 aa  283  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 
801 aa  280  9e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 
820 aa  277  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  31.88 
 
 
821 aa  276  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  31.82 
 
 
740 aa  274  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  32.23 
 
 
892 aa  274  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  32.28 
 
 
744 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 
877 aa  271  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
808 aa  270  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.62 
 
 
766 aa  268  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  31.81 
 
 
739 aa  268  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.02 
 
 
705 aa  265  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.78 
 
 
821 aa  261  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
710 aa  259  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  31.1 
 
 
784 aa  257  5e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.96 
 
 
737 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
710 aa  253  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.5 
 
 
763 aa  248  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.2 
 
 
736 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.45 
 
 
817 aa  244  3.9999999999999997e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  29.93 
 
 
807 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  29.83 
 
 
833 aa  232  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.87 
 
 
759 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  31.3 
 
 
1057 aa  230  9e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  31.31 
 
 
727 aa  224  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  29.52 
 
 
771 aa  218  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  30.45 
 
 
772 aa  218  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  33.54 
 
 
700 aa  217  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  29.71 
 
 
838 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  33.12 
 
 
703 aa  212  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  28.99 
 
 
761 aa  212  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 
766 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  29.65 
 
 
765 aa  207  5e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  30.83 
 
 
722 aa  201  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  30.01 
 
 
723 aa  200  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  30.18 
 
 
723 aa  199  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  29.68 
 
 
726 aa  197  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.94 
 
 
727 aa  194  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  28.49 
 
 
768 aa  193  9e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  29.25 
 
 
732 aa  188  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  28.53 
 
 
618 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  31.14 
 
 
860 aa  188  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  27.86 
 
 
648 aa  187  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  28.59 
 
 
643 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  31.13 
 
 
710 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
1245 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  27.9 
 
 
836 aa  184  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  29.19 
 
 
905 aa  184  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  28.55 
 
 
761 aa  182  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  29.1 
 
 
739 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  27.93 
 
 
750 aa  179  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  29.86 
 
 
757 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  29.92 
 
 
773 aa  179  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  27.91 
 
 
626 aa  179  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  27.71 
 
 
625 aa  178  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  27.93 
 
 
658 aa  179  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  27.92 
 
 
712 aa  177  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  27.11 
 
 
680 aa  176  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  28.83 
 
 
735 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  27.95 
 
 
704 aa  177  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  26.91 
 
 
710 aa  176  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  28.94 
 
 
734 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  27.96 
 
 
651 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  28.03 
 
 
727 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  25.07 
 
 
668 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  26.96 
 
 
814 aa  174  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2797  penicillin-binding protein, 1A family  28.53 
 
 
677 aa  173  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  29.22 
 
 
734 aa  173  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  29.69 
 
 
727 aa  172  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>