68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0465 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0465  secretory lipase  100 
 
 
439 aa  877    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1374  triacylglycerol lipase  44.7 
 
 
433 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141016  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1356  triacylglycerol lipase  44.7 
 
 
433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1338  triacylglycerol lipase  44.7 
 
 
433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  44.7 
 
 
415 aa  263  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02050  Secretory lipase  41.69 
 
 
451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  34.23 
 
 
444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0388  Triacylglycerol lipase  33.51 
 
 
422 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4826  Triacylglycerol lipase  32.47 
 
 
392 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3621  triacylglycerol lipase  29.56 
 
 
450 aa  111  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120078  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2796  triacylglycerol lipase  28.47 
 
 
450 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604768  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3130  triacylglycerol lipase  28.53 
 
 
450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.648254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3087  triacylglycerol lipase  28.53 
 
 
450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3070  triacylglycerol lipase  28.53 
 
 
450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11608  hypothetical protein  28.69 
 
 
446 aa  106  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.166185  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3188  Triacylglycerol lipase  26.94 
 
 
464 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0920741  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0434  triacylglycerol lipase  30.34 
 
 
447 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  28.09 
 
 
417 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0424  triacylglycerol lipase  30.34 
 
 
447 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424437  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0411  triacylglycerol lipase  30.34 
 
 
447 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.542327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  28.68 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28952  predicted protein  24.87 
 
 
482 aa  87.4  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0716767  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0186  Triacylglycerol lipase  25.69 
 
 
481 aa  86.7  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1963  secretory lipase  28.93 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1917  secretory lipase  28.93 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146897  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0814  secretory lipase  29.02 
 
 
444 aa  85.5  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  27.14 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0759  secretory lipase  26.82 
 
 
470 aa  83.2  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01799  secretory lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00110)  25.59 
 
 
450 aa  83.2  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0803381  normal  0.696532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1897  secretory lipase  28.27 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3821  secretory lipase  28.84 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583502  normal  0.737344 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06773  conserved hypothetical protein  29.36 
 
 
448 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355363  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3126  secretory lipase  37.44 
 
 
406 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0242733  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3922  secretory lipase  28.05 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0253176  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0048  Triacylglycerol lipase  27.44 
 
 
432 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  34.11 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  35.35 
 
 
427 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  34.88 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0441069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  32.42 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  31.48 
 
 
417 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  28.17 
 
 
376 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0733  putative exported lipase  27.76 
 
 
397 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  32.69 
 
 
385 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2256  secretory lipase  28.71 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454748  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3330  secretory lipase  34.74 
 
 
407 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  27.95 
 
 
376 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  26.04 
 
 
426 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  26.04 
 
 
377 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0264  secretory lipase  31.07 
 
 
395 aa  60.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  26.04 
 
 
377 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2614  secretory lipase  35.05 
 
 
427 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  25.97 
 
 
410 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  25.97 
 
 
410 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  25.97 
 
 
410 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0760  secretory lipase  26.89 
 
 
468 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0550  secretory lipase  24.11 
 
 
432 aa  56.6  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.70438  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0030  secretory lipase  31.82 
 
 
442 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  34.73 
 
 
383 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  33.58 
 
 
386 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0016  secretory lipase  37.8 
 
 
367 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1063  secretory lipase  31.62 
 
 
409 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  29.21 
 
 
413 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1203  secretory lipase  26.24 
 
 
434 aa  47.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2046  secretory lipase  33.95 
 
 
505 aa  46.6  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  29.56 
 
 
400 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  22.83 
 
 
433 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  31.09 
 
 
405 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4975  hypothetical protein  26.74 
 
 
401 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52355  hitchhiker  0.0000000664128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>