More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0414 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0414  Glutamate--tRNA ligase  100 
 
 		 309 aa  618  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1233  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  63.85 
 
 		 296 aa  354  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447568  normal  0.0288811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4941  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  61.36 
 
 		 293 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5029  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  61.36 
 
 		 293 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  62 
 
 		 319 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5322  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  60.68 
 
 		 293 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3764  Glutamate--tRNA ligase  61.17 
 
 		 297 aa  339  4e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5575  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  61.09 
 
 		 310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3985  glutamate--tRNA ligase  63.23 
 
 		 298 aa  332  7.000000000000001e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4042  Glutamate--tRNA ligase  62.59 
 
 		 285 aa  324  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02060  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  55.63 
 
 		 316 aa  299  4e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02670  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  45.11 
 
 		 323 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  43.99 
 
 		 323 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  44.65 
 
 		 323 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  41.1 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 479 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  47.1 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 329 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  38.44 
 
 		 373 aa  201  9e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 317 aa  199  7e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 469 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 		 535 aa  196  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 504 aa  197  3e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0111  glutamyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 462 aa  194  1e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 468 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  38.64 
 
 		 331 aa  192  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1562  glutamyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 460 aa  192  5e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000571227  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 469 aa  192  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 485 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 494 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  39.14 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  42.34 
 
 		 334 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  45.06 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000386478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3073  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  43.75 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 466 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2226  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  41.08 
 
 		 311 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178146  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 466 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 464 aa  189  7e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 477 aa  188  9e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 466 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 490 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 473 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 486 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 471 aa  188  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 		 491 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 		 477 aa  187  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 472 aa  187  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 469 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 		 469 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1780  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  43.8 
 
 		 314 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.234416 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1188  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44.14 
 
 		 310 aa  186  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0787184 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 		 486 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2196  glutamyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 		 463 aa  185  9e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000179412  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 		 468 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 485 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 498 aa  183  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 		 466 aa  183  4.0000000000000006e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 492 aa  182  5.0000000000000004e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1293  glutamyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 463 aa  182  6e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2709  glutamyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.63084  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 501 aa  182  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1480  glutamyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 463 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.499307  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0145  glutamyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 462 aa  181  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.092829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  33.87 
 
 		 495 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 463 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 466 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  45.16 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1023  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  41.98 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202098  hitchhiker  0.00000345941 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 492 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 467 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 485 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 467 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 470 aa  179  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 		 481 aa  179  4.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0242  glutamyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 		 459 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  39.86 
 
 		 518 aa  179  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 472 aa  178  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 		 467 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  40.31 
 
 		 327 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  32.05 
 
 		 482 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 495 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  40.47 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 481 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 465 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 474 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 464 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 		 491 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 470 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 		 465 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 478 aa  176  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 470 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 494 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>