More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0400 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 		 184 aa  378  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  85.87 
 
 		 184 aa  332  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  84.24 
 
 		 184 aa  328  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  84.24 
 
 		 184 aa  325  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  84.24 
 
 		 184 aa  325  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  83.15 
 
 		 184 aa  313  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  84.78 
 
 		 184 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  80.98 
 
 		 184 aa  303  9.000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  79.35 
 
 		 184 aa  303  9.000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  76.63 
 
 		 183 aa  301  3.0000000000000004e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  76.63 
 
 		 184 aa  298  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  79.89 
 
 		 183 aa  298  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  81.52 
 
 		 183 aa  298  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  74.32 
 
 		 183 aa  292  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  76.4 
 
 		 185 aa  290  5e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  81.44 
 
 		 216 aa  287  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  75.28 
 
 		 183 aa  284  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  75.54 
 
 		 226 aa  284  5e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  76.5 
 
 		 184 aa  283  7e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  73.6 
 
 		 183 aa  281  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  74.71 
 
 		 181 aa  280  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  85.33 
 
 		 264 aa  278  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  82.58 
 
 		 271 aa  277  7e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  70.49 
 
 		 183 aa  275  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  80.25 
 
 		 199 aa  275  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  79.25 
 
 		 182 aa  275  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  79.87 
 
 		 182 aa  274  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  77.85 
 
 		 226 aa  264  5.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  77.85 
 
 		 226 aa  263  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  72.9 
 
 		 180 aa  241  6e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.04 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  66.89 
 
 		 178 aa  228  5e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  65.41 
 
 		 179 aa  227  8e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  60.8 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  62.18 
 
 		 167 aa  216  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  61.54 
 
 		 167 aa  215  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  64.63 
 
 		 213 aa  214  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  60.37 
 
 		 174 aa  213  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56 
 
 		 202 aa  211  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.01 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.74 
 
 		 200 aa  201  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.33 
 
 		 170 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  56.58 
 
 		 170 aa  197  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.67 
 
 		 170 aa  197  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  56.58 
 
 		 170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  53.95 
 
 		 168 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.33 
 
 		 170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 		 159 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  59.46 
 
 		 166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.92 
 
 		 169 aa  195  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.88 
 
 		 183 aa  194  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  60.27 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  60.27 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  60.27 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  53.93 
 
 		 264 aa  193  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  60.27 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  60.27 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  60.27 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  60.27 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  60.27 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  60.27 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  60.27 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1150  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.84 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 		 170 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  53.64 
 
 		 159 aa  191  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  53.64 
 
 		 159 aa  191  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  57.72 
 
 		 172 aa  191  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.15 
 
 		 169 aa  191  5e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  55.26 
 
 		 171 aa  191  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.7 
 
 		 191 aa  191  8e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  57.52 
 
 		 158 aa  190  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  57.62 
 
 		 160 aa  190  9e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  57.62 
 
 		 160 aa  190  9e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  55.77 
 
 		 158 aa  190  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  55.77 
 
 		 158 aa  190  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  52.98 
 
 		 159 aa  190  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  56.86 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.03 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  52.82 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0950  NADH dehydrogenase subunit B  54.9 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0972476  normal  0.726219 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  52.32 
 
 		 159 aa  189  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  54.67 
 
 		 167 aa  189  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.21 
 
 		 159 aa  189  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  52 
 
 		 268 aa  189  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50 
 
 		 794 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  56.21 
 
 		 158 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2060  NADH dehydrogenase subunit B  54.9 
 
 		 158 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  56.67 
 
 		 173 aa  187  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 		 170 aa  188  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  53.06 
 
 		 213 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1143  NADH dehydrogenase subunit B  54.25 
 
 		 158 aa  187  5.999999999999999e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0196074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50 
 
 		 794 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  48.28 
 
 		 220 aa  186  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  48.28 
 
 		 220 aa  186  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  54.25 
 
 		 160 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  48.28 
 
 		 220 aa  186  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  48.28 
 
 		 220 aa  186  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.56 
 
 		 158 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  55.03 
 
 		 193 aa  186  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>