90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0353 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  33.65 
 
 		 1640 aa  781    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  61.8 
 
 		 1546 aa  1910    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  34.09 
 
 		 1557 aa  801    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  44.15 
 
 		 1581 aa  1161    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  100 
 
 		 1573 aa  3217    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  34.17 
 
 		 1579 aa  801    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1644 aa  809    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  43.28 
 
 		 1572 aa  1098    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  34.28 
 
 		 1640 aa  794    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  44.11 
 
 		 1575 aa  1102    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  34.22 
 
 		 1642 aa  790    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1751 aa  622  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  24.75 
 
 		 1343 aa  170  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  27.68 
 
 		 1432 aa  136  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1581 aa  126  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  28.9 
 
 		 1336 aa  125  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  28.41 
 
 		 1338 aa  124  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1422 aa  117  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1353 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  22.95 
 
 		 1318 aa  114  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1339 aa  114  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  28.4 
 
 		 1354 aa  109  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  25.88 
 
 		 1712 aa  109  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1426 aa  108  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1333 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1373 aa  107  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1461 aa  106  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1282 aa  106  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  26.86 
 
 		 1290 aa  103  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  25.85 
 
 		 846 aa  98.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1342 aa  96.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  29.02 
 
 		 1306 aa  95.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1250 aa  94.7  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1250 aa  94  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1321 aa  93.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1452 aa  92.8  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1441 aa  92.8  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1459 aa  91.7  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  25.47 
 
 		 1277 aa  91.7  1e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  27.82 
 
 		 1331 aa  90.5  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1612 aa  89.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  25.9 
 
 		 1319 aa  89.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  25 
 
 		 1358 aa  89.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  25.44 
 
 		 1219 aa  88.6  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  25.48 
 
 		 1355 aa  87.8  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  27 
 
 		 1322 aa  87.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  35.06 
 
 		 1338 aa  87  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  24.85 
 
 		 1321 aa  86.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  24.84 
 
 		 1278 aa  84.7  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1098 aa  83.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1709 aa  82  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1365 aa  79.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1332 aa  79  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1375 aa  78.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  27 
 
 		 1243 aa  77.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1022 aa  76.3  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  32.48 
 
 		 1055 aa  75.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1409 aa  72  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  27.59 
 
 		 974 aa  71.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  26.75 
 
 		 1442 aa  70.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1347 aa  68.6  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  22.39 
 
 		 1244 aa  67.8  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  22.39 
 
 		 1257 aa  67.4  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1298 aa  67  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  22.09 
 
 		 1252 aa  66.6  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  31 
 
 		 1339 aa  65.9  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  31 
 
 		 1339 aa  65.9  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  38 
 
 		 1041 aa  65.1  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1349 aa  63.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1346 aa  60.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1366 aa  59.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  29.17 
 
 		 1322 aa  59.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1440 aa  59.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1363 aa  58.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  31.29 
 
 		 1347 aa  56.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  26.54 
 
 		 995 aa  55.8  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  26.71 
 
 		 1058 aa  55.5  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  30.77 
 
 		 926 aa  55.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  24.8 
 
 		 1186 aa  53.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  32 
 
 		 1231 aa  52.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  22.31 
 
 		 1256 aa  50.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  28.91 
 
 		 1177 aa  49.3  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  24.7 
 
 		 1089 aa  48.9  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  28.75 
 
 		 950 aa  48.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1104 aa  47.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  21.37 
 
 		 1020 aa  47  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1425 aa  45.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1147 aa  46.2  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1088 aa  45.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1102  putative DNA methyltransferase  33.73 
 
 		 1100 aa  45.1  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.822518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>