More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0320 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0320  ferredoxin  100 
 
 
348 aa  706    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  49.26 
 
 
352 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2893  ferredoxin  47.62 
 
 
347 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200106  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0310  oxidoreductase FAD-binding subunit  49.85 
 
 
339 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13604  hemoglobine-related protein hmp  46.76 
 
 
358 aa  295  5e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.714491  normal  0.806459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5309  ferredoxin  45.92 
 
 
356 aa  296  5e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0319  ferredoxin  48.64 
 
 
346 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0329  ferredoxin  48.64 
 
 
346 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1462  ferredoxin  44.82 
 
 
358 aa  288  8e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611989  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  46.67 
 
 
345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4710  ferredoxin  44.18 
 
 
350 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4796  ferredoxin  44.18 
 
 
350 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5095  ferredoxin  44.18 
 
 
350 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.276207 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3517  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  47.32 
 
 
346 aa  270  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.611569  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  45.51 
 
 
351 aa  265  7e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.74 
 
 
354 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2520  ferredoxin  42.7 
 
 
366 aa  252  7e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2674  ferredoxin  42.94 
 
 
330 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.29 
 
 
341 aa  249  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18640  flavodoxin reductase family protein  42.5 
 
 
355 aa  249  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3447  ferredoxin  41.95 
 
 
340 aa  245  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1416  ferredoxin  43.17 
 
 
353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3851  ferredoxin  43.89 
 
 
360 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4186  ferredoxin  39.05 
 
 
346 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  34.29 
 
 
361 aa  203  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3712  ferredoxin  37.76 
 
 
339 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.709133  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3785  ferredoxin  37.76 
 
 
339 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870039  normal  0.280135 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3725  ferredoxin  37.76 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2973  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.41 
 
 
341 aa  199  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2468  ferredoxin  36.58 
 
 
344 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3372  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.78 
 
 
369 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0543  ferredoxin  36.47 
 
 
339 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4306  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.23 
 
 
329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.264864  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0900  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.41 
 
 
389 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4285  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.14 
 
 
362 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481656  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1828  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.43 
 
 
362 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488384  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.43 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3637  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.04 
 
 
365 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7195  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.14 
 
 
358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0757  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.33 
 
 
358 aa  172  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123298  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3115  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  34.37 
 
 
362 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136188  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2577  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  34.37 
 
 
362 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.616553  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1980  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  34.37 
 
 
362 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.144649  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0008  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.37 
 
 
362 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0203524  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3533  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  34.37 
 
 
362 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3779  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.37 
 
 
362 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0589683  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0011  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.37 
 
 
362 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3840  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.37 
 
 
362 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0608  ferredoxin reductase protein  34.18 
 
 
363 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4563  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.65 
 
 
364 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.659135 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3491  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.65 
 
 
364 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.168778 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3373  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase PaaK subunit  34.17 
 
 
361 aa  169  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1502  ferredoxin  32.96 
 
 
365 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4069  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.51 
 
 
369 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4151  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.73 
 
 
358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.522682  normal  0.83112 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3101  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.52 
 
 
362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0125326  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0228  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.52 
 
 
362 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0180747  hitchhiker  0.0014836 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0381  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  32.02 
 
 
365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.155408  hitchhiker  0.00902786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.85 
 
 
356 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0306  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.24 
 
 
362 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.144813  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0254  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.24 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0292434  normal  0.0307686 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0245  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.24 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3425  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.96 
 
 
362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0901107  normal  0.882381 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2780  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.24 
 
 
362 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0478602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0326  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.24 
 
 
362 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.85 
 
 
357 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05340  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaK subunit  31.23 
 
 
357 aa  162  5.0000000000000005e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000116603  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2861  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.67 
 
 
362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257919 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20190  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.36 
 
 
389 aa  162  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.864548  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5717  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.83 
 
 
369 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3352  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.09 
 
 
358 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4880  ferredoxin  34.5 
 
 
350 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.30814 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.37 
 
 
358 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.234643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0377  ferredoxin  35.08 
 
 
350 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0291  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  32.68 
 
 
362 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0991  putative ring-hydroxylation complex protein 4  33.23 
 
 
361 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153237  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3739  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.96 
 
 
358 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184178  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3666  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.39 
 
 
362 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100364  hitchhiker  0.000000384073 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3210  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.99 
 
 
362 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2869  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase paaE  33.33 
 
 
337 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.236927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1903  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.23 
 
 
368 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  33.23 
 
 
356 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.88 
 
 
351 aa  155  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1242  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase PaaK subunit  34.09 
 
 
366 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2612  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.43 
 
 
362 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3274  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.43 
 
 
358 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60541  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.81 
 
 
360 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4468  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.65 
 
 
369 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.488012  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0932  ferredoxin  33.43 
 
 
358 aa  153  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2635  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.53 
 
 
358 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.0570519 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2143  ferredoxin  30.34 
 
 
344 aa  151  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000191342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.97 
 
 
358 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2960  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.92 
 
 
413 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2485  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.25 
 
 
358 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0651  ferredoxin  32.56 
 
 
353 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1231  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.63 
 
 
364 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.09 
 
 
348 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3076  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.16 
 
 
352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.163455 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03005  Phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.98 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1748  ferredoxin  32.87 
 
 
351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.764981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>