More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0297 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0297  Mg2 transporter protein CorA family protein  100 
 
 
354 aa  724    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1217  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  56.81 
 
 
330 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732452  normal  0.131023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5126  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  55.94 
 
 
330 aa  378  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.913238  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0906  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  55.23 
 
 
331 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0923  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  55.23 
 
 
331 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0913  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  55.23 
 
 
331 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0926548  decreased coverage  0.00569345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0414  Mg2 transporter protein CorA family protein  44.96 
 
 
322 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0053  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  43.87 
 
 
330 aa  276  5e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0614291  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0485  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.9 
 
 
322 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3718  Mg2 transporter protein CorA family protein  43.34 
 
 
330 aa  262  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0970  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.9 
 
 
342 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.609858  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1754  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.92 
 
 
324 aa  226  6e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3668  Mg2 transporter protein CorA family protein  49.14 
 
 
304 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.12 
 
 
339 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  29 
 
 
321 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1248  Mg2 transporter protein CorA family protein  40.91 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0484421  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.49 
 
 
322 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.74 
 
 
339 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1091  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.43 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0387  putative metal ion transporter  26.87 
 
 
372 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0065  Mg2+ transporter protein, CorA-like  29.03 
 
 
323 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2221  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.12 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.11 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4550  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.17 
 
 
323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3478  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.17 
 
 
323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.119189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0036  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  27.57 
 
 
360 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1482  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.2 
 
 
325 aa  132  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0136304  normal  0.215972 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.86 
 
 
325 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0642  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.93 
 
 
327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.459619  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0899  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.63 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01784  magnesium/cobalt transporter CorA  27.75 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0674  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.65 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5013  magnesium/cobalt transporter CorA  26.5 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117877  normal  0.108957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3541  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.36 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3587  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.24 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5733  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.97 
 
 
321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0171  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.27 
 
 
365 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215108  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1813  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.42 
 
 
367 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.406453  normal  0.0884578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0198  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.38 
 
 
357 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2421  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.71 
 
 
322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.93 
 
 
325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.64 
 
 
325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1642  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.93 
 
 
325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.36 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.36 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3987  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.33 
 
 
375 aa  126  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1621  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.86 
 
 
326 aa  125  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0113  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.18 
 
 
378 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0453825  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.8 
 
 
325 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  25.66 
 
 
325 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06540  Mg2+/Co2+ transporter  28.7 
 
 
363 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.82 
 
 
325 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0816  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.08 
 
 
367 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5404  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.43 
 
 
326 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0808766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1081  magnesium/cobalt transporter CorA  27.7 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99494  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4421  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.22 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377619  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0271  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.47 
 
 
370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6428  magnesium/cobalt transporter CorA  27.65 
 
 
380 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.87 
 
 
322 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2098  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.08 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4111  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.85 
 
 
417 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1428  magnesium/cobalt transporter CorA  26.26 
 
 
384 aa  119  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.26 
 
 
354 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2504  putative metal ion transport protein  26.24 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.67 
 
 
291 aa  116  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1248  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.09 
 
 
380 aa  116  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.713487  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.74 
 
 
354 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2163  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.82 
 
 
358 aa  115  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0100402  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1347  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.71 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11264  magnesium and cobalt transport transmembrane protein corA  28.22 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00777117  hitchhiker  0.000740018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4484  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.7 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00540479 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0287  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.99 
 
 
436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523176  normal  0.774272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1999  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.14 
 
 
324 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.403451  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.56 
 
 
354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00453  magnesium and cobalt transport protein  28.32 
 
 
333 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2565  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.61 
 
 
331 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0126  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.5 
 
 
322 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000115284  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.86 
 
 
325 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.3 
 
 
353 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.86 
 
 
325 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.86 
 
 
325 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2837  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.25 
 
 
338 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.23809 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5093  Mg2 transporter protein CorA family protein  26 
 
 
347 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0875597  hitchhiker  0.0090718 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.63 
 
 
355 aa  112  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.4 
 
 
341 aa  112  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1421  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.29 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2538  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.37 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.52 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  25.54 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.68 
 
 
367 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.76 
 
 
325 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0979  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.57 
 
 
325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272451  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.28 
 
 
351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1888  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.05 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2213  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.93 
 
 
365 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.03 
 
 
356 aa  110  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2311  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.79 
 
 
325 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2307  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.91 
 
 
322 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0204  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.25 
 
 
391 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174805  hitchhiker  0.00515093 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3755  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  26.25 
 
 
338 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>