67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0276 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0276  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
301 aa  608  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0949477  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4102  glycosyl transferase family 2  76.25 
 
 
313 aa  435  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.694392  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1185  glycosyl transferase family protein  69.7 
 
 
304 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5373  glycosyl transferase family protein  72.82 
 
 
297 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4992  glycosyl transferase family protein  72.82 
 
 
297 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5080  glycosyl transferase family protein  72.82 
 
 
297 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.566674 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13816  L-rhamnosyltransferase  68.77 
 
 
304 aa  383  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.660189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5619  glycosyl transferase family protein  67.62 
 
 
313 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0132  glycosyl transferase family 2  64.29 
 
 
298 aa  350  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01490  predicted glycosyltransferase  62.85 
 
 
303 aa  334  9e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.731654  normal  0.0270435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4321  glycosyl transferase family 2  60.34 
 
 
307 aa  331  7.000000000000001e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2615  glycosyl transferase family protein  38.49 
 
 
298 aa  159  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2348  glycosyl transferase family 2  37.67 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000992199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  35.02 
 
 
302 aa  108  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
315 aa  99  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  29.31 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
332 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
306 aa  85.9  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  28.16 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  23.99 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1638  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  25.89 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1125  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  39.13 
 
 
322 aa  67  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  30.17 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08750  predicted glycosyltransferase  28.97 
 
 
313 aa  62.8  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0987948  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  25.13 
 
 
306 aa  61.6  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  23.85 
 
 
722 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
489 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0630  glycosyl transferase family 2  30.35 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  29.14 
 
 
615 aa  59.7  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  23.98 
 
 
337 aa  59.3  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0821  glycosyltransferase, group 2 family protein  32.31 
 
 
344 aa  59.3  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  26.2 
 
 
455 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
323 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2546  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
341 aa  57  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  24.52 
 
 
303 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0770  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.11 
 
 
333 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  26.49 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  23.61 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
340 aa  52.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3203  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
328 aa  52.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0877  putative glycosyl transferase  33.63 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.277014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0843  putative glycosyl transferase  33.63 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000580713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0780  putative glycosyl transferase  33.63 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0260013  normal  0.0469615 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  24.32 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.92 
 
 
327 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
302 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
330 aa  49.7  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 
246 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  20.45 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  23.6 
 
 
305 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  22.57 
 
 
314 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2894  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 
285 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 
320 aa  45.8  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3445  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.38 
 
 
333 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867023  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
340 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 
308 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4831  glycosyl transferase family 2  21.29 
 
 
294 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 
329 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
671 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  21.03 
 
 
311 aa  42.7  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 
298 aa  42.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>