More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0252 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
474 aa  977    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  82.03 
 
 
476 aa  820    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.96 
 
 
456 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  64.96 
 
 
456 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.96 
 
 
456 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.58 
 
 
472 aa  597  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  63 
 
 
463 aa  592  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  61.42 
 
 
461 aa  560  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  57.68 
 
 
453 aa  542  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  50.65 
 
 
481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  45.09 
 
 
468 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.21 
 
 
454 aa  347  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  40.26 
 
 
455 aa  329  7e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  41.19 
 
 
452 aa  327  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  38.57 
 
 
462 aa  296  7e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  35.62 
 
 
452 aa  276  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  33.41 
 
 
443 aa  264  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  35.55 
 
 
464 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  34.13 
 
 
457 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  34.13 
 
 
457 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.63 
 
 
433 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.29 
 
 
432 aa  249  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  34.85 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  35.98 
 
 
430 aa  242  9e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  33.84 
 
 
440 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  36.28 
 
 
432 aa  229  9e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.16 
 
 
435 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  32.84 
 
 
436 aa  227  4e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  35.6 
 
 
432 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  36.59 
 
 
436 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  35.03 
 
 
472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.81 
 
 
444 aa  219  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.7 
 
 
447 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  31.16 
 
 
444 aa  217  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  35.25 
 
 
437 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.42 
 
 
433 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.89 
 
 
433 aa  216  9e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  33.85 
 
 
442 aa  213  7e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.75 
 
 
440 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  32.1 
 
 
438 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  35.89 
 
 
438 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.05 
 
 
437 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  35.47 
 
 
438 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  32.61 
 
 
442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  36.18 
 
 
438 aa  199  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  33.57 
 
 
432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  30.75 
 
 
444 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.54 
 
 
441 aa  186  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  28.63 
 
 
425 aa  186  9e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  28.87 
 
 
431 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  29.67 
 
 
431 aa  160  7e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.42 
 
 
445 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  21.94 
 
 
481 aa  84  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  23.15 
 
 
475 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  21.29 
 
 
478 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  21.52 
 
 
478 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  20.18 
 
 
761 aa  68.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  21.3 
 
 
471 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  20.84 
 
 
478 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  21.3 
 
 
478 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  21.79 
 
 
471 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  25 
 
 
436 aa  66.6  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  21.79 
 
 
478 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  23.9 
 
 
433 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.55 
 
 
462 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  23.39 
 
 
428 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  20.44 
 
 
478 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  22.3 
 
 
432 aa  63.9  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  30.4 
 
 
455 aa  63.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  21.95 
 
 
468 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8623  FAD linked oxidase domain protein  34.38 
 
 
1067 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  30.07 
 
 
491 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.19 
 
 
483 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  22.15 
 
 
438 aa  61.6  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  30.51 
 
 
434 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  30.65 
 
 
441 aa  61.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  26.32 
 
 
574 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  28.97 
 
 
441 aa  60.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  22.89 
 
 
437 aa  60.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  28.68 
 
 
456 aa  60.1  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  29.92 
 
 
460 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  29.68 
 
 
457 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.01 
 
 
456 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2480  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.99 
 
 
1013 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  28.28 
 
 
378 aa  57.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  34.11 
 
 
894 aa  57  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.83 
 
 
490 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  25.73 
 
 
499 aa  57  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0818  hypothetical protein  31.97 
 
 
1021 aa  57  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.103467  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  23.08 
 
 
475 aa  57  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1864  FAD linked oxidase domain protein  30.28 
 
 
1013 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23854  hitchhiker  0.000000575821 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2161  hypothetical protein  26.79 
 
 
470 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2161  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.74 
 
 
1024 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08380  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28 
 
 
479 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2487  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.28 
 
 
1013 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2600  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.28 
 
 
1013 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.575227  normal  0.0164973 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  25.24 
 
 
499 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  27.09 
 
 
499 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1894  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.5 
 
 
500 aa  55.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.140191 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.87 
 
 
1023 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>