More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0215 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0215  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 1759 aa  3544    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0175  Beta-ketoacyl synthase  55.75 
 
 		 1704 aa  1912    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5010  mycolic acid condensase  50.77 
 
 		 1850 aa  1744    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398099  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1169  beta-ketoacyl synthase  51.11 
 
 		 1778 aa  1693    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5098  mycolic acid condensase  50.77 
 
 		 1850 aa  1744    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  37.73 
 
 		 1828 aa  653    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5640  beta-ketoacyl synthase  51.08 
 
 		 1840 aa  1721    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13834  polyketide synthase pks13  53.11 
 
 		 1733 aa  1740    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.924162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5391  mycolic acid condensase  50.88 
 
 		 1841 aa  1744    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.568304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  39.05 
 
 		 1823 aa  635  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  38.58 
 
 		 1580 aa  629  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  38.58 
 
 		 1580 aa  629  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  38.8 
 
 		 1581 aa  624  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  38.87 
 
 		 1876 aa  626  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  38.02 
 
 		 1580 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  39.43 
 
 		 1577 aa  616  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  38.65 
 
 		 2111 aa  613  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  34.59 
 
 		 2333 aa  561  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  37.93 
 
 		 2220 aa  560  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  38.08 
 
 		 1806 aa  555  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  35.82 
 
 		 1656 aa  556  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  37.63 
 
 		 1835 aa  555  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  34.87 
 
 		 1190 aa  550  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  34.87 
 
 		 1190 aa  550  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  34.79 
 
 		 1190 aa  549  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  37.49 
 
 		 1805 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  36.27 
 
 		 2085 aa  536  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  36.27 
 
 		 2085 aa  536  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  36.27 
 
 		 2085 aa  536  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  39.26 
 
 		 1520 aa  532  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  39.26 
 
 		 1520 aa  532  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  36.19 
 
 		 1704 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  36.19 
 
 		 1704 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  37.9 
 
 		 1822 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  35.79 
 
 		 2232 aa  514  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  35.44 
 
 		 3254 aa  512  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  34.38 
 
 		 3158 aa  511  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  36.02 
 
 		 3676 aa  509  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  34.97 
 
 		 6768 aa  504  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  34.67 
 
 		 2230 aa  501  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  35.23 
 
 		 3696 aa  499  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  36.84 
 
 		 1812 aa  498  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  35.8 
 
 		 3702 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  35.39 
 
 		 3101 aa  500  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  34.7 
 
 		 4151 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  35.59 
 
 		 3693 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  35.59 
 
 		 3693 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  34.2 
 
 		 3679 aa  491  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  33.92 
 
 		 1587 aa  490  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 		 5154 aa  493  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  35.32 
 
 		 2111 aa  490  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  34.72 
 
 		 7210 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  34.51 
 
 		 2108 aa  485  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3852  beta-ketoacyl synthase  35.34 
 
 		 1744 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  33.92 
 
 		 2890 aa  482  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  35.37 
 
 		 2225 aa  478  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  35.3 
 
 		 2101 aa  479  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  35.46 
 
 		 2188 aa  478  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  34.73 
 
 		 2374 aa  479  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  49.72 
 
 		 2162 aa  479  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 		 1874 aa  474  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.58 
 
 		 1822 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  35.42 
 
 		 1832 aa  475  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.72 
 
 		 1337 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.65 
 
 		 2551 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  34.59 
 
 		 2020 aa  473  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  34.91 
 
 		 2376 aa  470  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 7110 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  35.38 
 
 		 5255 aa  469  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  34.85 
 
 		 1789 aa  466  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  34.71 
 
 		 2126 aa  465  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.29 
 
 		 1305 aa  464  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  35.56 
 
 		 1831 aa  466  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  34.08 
 
 		 3408 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  34.73 
 
 		 3176 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  33.2 
 
 		 1559 aa  459  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  32.83 
 
 		 2486 aa  459  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  32.83 
 
 		 2486 aa  459  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.09 
 
 		 1559 aa  459  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  34.2 
 
 		 1827 aa  458  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  33.3 
 
 		 2126 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  32.96 
 
 		 4930 aa  455  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  32.47 
 
 		 3449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  32.36 
 
 		 3337 aa  457  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  34.35 
 
 		 3148 aa  452  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  33.26 
 
 		 1548 aa  450  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  33.71 
 
 		 2545 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  33.59 
 
 		 2847 aa  449  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  33.43 
 
 		 4478 aa  450  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  32.6 
 
 		 2462 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 3874 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  33.27 
 
 		 4080 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  30.37 
 
 		 3099 aa  446  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  33.2 
 
 		 2543 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  32.65 
 
 		 4111 aa  443  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  32.67 
 
 		 4882 aa  439  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  33.74 
 
 		 2966 aa  440  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  33.2 
 
 		 1584 aa  440  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  33.2 
 
 		 4165 aa  440  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  33.87 
 
 		 2846 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>