129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0197 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0197  SpoIID/LytB domain protein  100 
 
 		 538 aa  1077    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0160  SpoIID/LytB domain protein  49.73 
 
 		 735 aa  337  3.9999999999999995e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3764  Stage II sporulation D domain protein  45.62 
 
 		 305 aa  192  9e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2562  SpoIID/LytB domain protein  39.73 
 
 		 711 aa  180  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1742  SpoIID/LytB domain protein  35.75 
 
 		 1032 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.334202  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0423  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.61 
 
 		 874 aa  136  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3515  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.81 
 
 		 417 aa  133  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  30.89 
 
 		 664 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3325  SpoIID/LytB domain protein  33.06 
 
 		 377 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0346902  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3516  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.89 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395266  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1179  SpoIID/LytB domain protein  32.2 
 
 		 658 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0278  SpoIID/LytB domain protein  33.18 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5043  SpoIID/LytB domain protein  30.35 
 
 		 386 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  35.2 
 
 		 625 aa  99  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0527  SpoIID/LytB domain protein  27.46 
 
 		 546 aa  96.3  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000920143  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0920  SpoIID/LytB domain protein  31.82 
 
 		 437 aa  93.6  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0663861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1794  SpoIID/LytB domain protein  28.69 
 
 		 720 aa  93.2  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160859 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2625  SpoIID/LytB domain protein  35.68 
 
 		 368 aa  92.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1362  SpoIID/LytB domain protein  31.7 
 
 		 382 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1392  SpoIID/LytB domain protein  31.7 
 
 		 382 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2012  stage II sporulation protein D-like  28.3 
 
 		 407 aa  90.5  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.703242 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4218  sporulation protein SpoIID-like  35.1 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000195999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14021  sporulation protein SpoIID  28.1 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.388371  normal  0.301012 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15491  sporulation protein SpoIID  30.65 
 
 		 391 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  23.68 
 
 		 762 aa  89  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15341  sporulation protein SpoIID  28.57 
 
 		 391 aa  88.6  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00436171  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1446  sporulation protein SpoIID-like  29.56 
 
 		 391 aa  87  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0642  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.95 
 
 		 388 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0335731  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4515  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.91 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3247  SpoIID/LytB domain protein  30.94 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2359  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.3 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000614702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0035  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.79 
 
 		 508 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000486765  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2687  SpoIID/LytB domain protein  33.62 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2831  SpoIID/LytB domain protein  33.05 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.835206  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1696  sporulation protein and related proteins-like  25.77 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0960  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.22 
 
 		 570 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000216534  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15091  sporulation protein SpoIID  30.05 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1118  SpoIID/LytB domain protein  27.13 
 
 		 463 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.819333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05351  sporulation protein SpoIID  33.05 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0919  sporulation protein SpoIID  31.03 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17751  sporulation protein SpoIID  30.39 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1608  SpoIID/LytB domain protein  28.5 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1802  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.4 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.806202  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2144  stage II sporulation protein D-like  31.74 
 
 		 495 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3805  sporulation stage II protein D  31.91 
 
 		 337 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10950  SpoIID/LytB domain protein  26.26 
 
 		 708 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0118961  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14861  hypothetical protein  41.44 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.244523 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0630  SpoIID/LytB domain protein  28.3 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3624  SpoIID/LytB domain protein  31.66 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000549962  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0380  SpoIID/LytB domain-containing protein  37.4 
 
 		 686 aa  70.1  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000403516  hitchhiker  0.0000000000012381 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1767  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.49 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5407  stage II sporulation protein D  29.63 
 
 		 339 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2621  stage II sporulation-related protein  37.1 
 
 		 321 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0087  sporulation protein and related proteins  33.97 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00338057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2187  SpoIID/LytB domain protein  26.7 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1714  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.34 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2281  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.27 
 
 		 563 aa  65.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00377918  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0700  SpoIID/LytB domain-containing protein  37.88 
 
 		 503 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1785  sporulation protein and related proteins-like  28.21 
 
 		 526 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.450539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0850  stage II sporulation-related protein  28.9 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5543  stage II sporulation protein D  29.63 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00744425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0506  SpoIID/LytB domain-containing protein  35.19 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.133427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0533  stage II sporulation protein D-like  31.39 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5084  sporulation stage II protein D  28.88 
 
 		 339 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5462  stage II sporulation protein D  29.07 
 
 		 339 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000156076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1780  SpoIID/LytB domain protein  34.23 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174571 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4968  stage II sporulation protein D  29.3 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0719716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4986  stage II sporulation protein D  29.8 
 
 		 339 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.579357  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5377  stage II sporulation protein D  29.3 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000599037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2437  SpoIID/LytB domain protein  33.33 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.712007  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0502  SpoIID/LytB domain protein  33.07 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5411  stage II sporulation protein D  29.51 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0080939  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2039  SpoIID/LytB domain protein  27.32 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000207562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2013  SpoIID/LytB domain protein  33.6 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.588704  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3924  SpoIID/LytB domain protein  36.63 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5136  stage II sporulation protein D  29.39 
 
 		 339 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5528  stage II sporulation protein D  29.39 
 
 		 339 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2376  stage II sporulation protein D  25.74 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0244  SpoIID/LytB domain protein  25.93 
 
 		 584 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3479  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.79 
 
 		 852 aa  59.3  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00505256  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0757  amidase enhancer  31.06 
 
 		 555 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0085  stage II sporulation protein D  28.35 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.622828  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17760  sporulation stage II protein D  28.91 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.377102  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2014  SpoIID/LytB domain protein  26.94 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2597  SpoIID/LytB domain protein  38.26 
 
 		 493 aa  57  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1838  SpoIID/LytB domain protein  29.23 
 
 		 871 aa  56.2  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0180  SpoIID/LytB domain-containing protein  37.27 
 
 		 533 aa  56.2  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1599  hypothetical protein  36.7 
 
 		 361 aa  55.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.899582  normal  0.526265 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0221  SpoIID/LytB domain protein  28.32 
 
 		 316 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000520867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0712  SpoIID/LytB domain protein  35.45 
 
 		 586 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2108  sporulation protein and related proteins  34.26 
 
 		 326 aa  55.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1268  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.05 
 
 		 321 aa  54.7  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1304  SpoIID/LytB domain protein  32.88 
 
 		 291 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1405  SpoIID/LytB domain protein  32.88 
 
 		 291 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2545  stage II sporulation-related protein  32.88 
 
 		 291 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  39.33 
 
 		 708 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4787  SpoIID/LytB domain protein  30.83 
 
 		 313 aa  53.9  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3147  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.33 
 
 		 320 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3287  stage II sporulation protein D  26.91 
 
 		 342 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1128  hypothetical protein  36.26 
 
 		 171 aa  52.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.834163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>