More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0175 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0175  Prephenate dehydratase  100 
 
 		 328 aa  641    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439201  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  51.25 
 
 		 309 aa  285  9e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  52.96 
 
 		 312 aa  276  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13872  prephenate dehydratase  51.41 
 
 		 321 aa  275  9e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5415  prephenate dehydratase  51.86 
 
 		 315 aa  268  7e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5034  prephenate dehydratase  51.86 
 
 		 315 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431184  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5122  prephenate dehydratase  51.86 
 
 		 315 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0145  Prephenate dehydratase  52.98 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  42.06 
 
 		 316 aa  199  7.999999999999999e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  43.64 
 
 		 311 aa  198  9e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0377  Prephenate dehydratase  38.6 
 
 		 335 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  40.12 
 
 		 318 aa  186  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  39.09 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  38.11 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  39.32 
 
 		 305 aa  180  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  40.48 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  40.12 
 
 		 305 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  37.69 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  38.96 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0100  Prephenate dehydratase  42.68 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863601  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  39.23 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  37.92 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3187  Prephenate dehydratase  40.84 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.019372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  38.18 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  37.08 
 
 		 318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06790  prephenate dehydratase  38.41 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.299471  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0218  Prephenate dehydratase  43.3 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01190  prephenate dehydratase  40.37 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0245  Prephenate dehydratase  39.17 
 
 		 314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00775166  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  38.63 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  38.05 
 
 		 372 aa  156  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  36.86 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  32.65 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.86 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  33.79 
 
 		 360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  31.53 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  38.93 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  32.99 
 
 		 385 aa  146  5e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  30.82 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  36.77 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  36.77 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  37.11 
 
 		 277 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  36.43 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  32.18 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  32.19 
 
 		 364 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  32.88 
 
 		 272 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  33.79 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  32.54 
 
 		 367 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  32.54 
 
 		 364 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  32 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  32.54 
 
 		 364 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  33.45 
 
 		 365 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.22 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.45 
 
 		 364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  32.65 
 
 		 364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  32.31 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  33.44 
 
 		 413 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  36.3 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  35.93 
 
 		 279 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  32.42 
 
 		 358 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  31.96 
 
 		 381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  31.19 
 
 		 359 aa  133  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.88 
 
 		 371 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  31.16 
 
 		 365 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  30.58 
 
 		 402 aa  132  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  30.85 
 
 		 359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  31.16 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  32.76 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  30.1 
 
 		 277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.48 
 
 		 358 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.38 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  33.33 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  28.38 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  29.97 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  28.52 
 
 		 374 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  36.42 
 
 		 306 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  34.59 
 
 		 286 aa  126  6e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  30.87 
 
 		 360 aa  125  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  28.9 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  33.45 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  31.03 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  28.18 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  32.66 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  32.66 
 
 		 279 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.27 
 
 		 365 aa  123  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.38 
 
 		 368 aa  122  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  27.49 
 
 		 359 aa  122  8e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  32.78 
 
 		 279 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  32.08 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  29.97 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.61 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  32.09 
 
 		 279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  30.58 
 
 		 365 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  32.09 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  30 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  31.56 
 
 		 397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.43 
 
 		 368 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  29.21 
 
 		 418 aa  119  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  30.85 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2048  Prephenate dehydratase  32.76 
 
 		 383 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>