37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0173 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  100 
 
 		 268 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  51.57 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  51.03 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  52.59 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  52.19 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  51.79 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  53.04 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  48.25 
 
 		 259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  51.79 
 
 		 268 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  51.79 
 
 		 268 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  47.86 
 
 		 259 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  47.86 
 
 		 259 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  47.7 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  45.08 
 
 		 277 aa  196  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  48.37 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  46.09 
 
 		 253 aa  175  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  47.22 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  44.14 
 
 		 282 aa  172  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  43.32 
 
 		 263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  44.4 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  42.08 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  40.08 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  39.92 
 
 		 255 aa  148  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  43.27 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  42.74 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  41.53 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  42.31 
 
 		 269 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  40.77 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  54.14 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  43.11 
 
 		 242 aa  132  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  39.68 
 
 		 296 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  45.31 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  41.46 
 
 		 437 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  37.55 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4016  hypothetical protein  40 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.905588  normal  0.0158572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  32.58 
 
 		 251 aa  52.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  25.44 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>